典型文献
棉花黄萎病相关基因GhMYB6的克隆与功能分析
文献摘要:
[目的]克隆陆地棉MYB家族基因GhMYB6,并对其在棉花抗黄萎病反应中的功能进行初步探究,为挖掘棉花抗病相关基因及棉花抗病育种提供参考.[方法]基于棉花转录组测序数据,筛选并克隆了响应黄萎病菌侵染的基因GhMYB6,对其序列进行生物信息学分析,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测其在黄萎病诱导下的表达模式,并利用病毒诱导的基因沉默(VIGS)技术初步验证棉花抗黄萎病中的生物学功能.[结果]克隆获得的GhMYB6基因开放阅读框(ORF)为258 bp,编码85个氨基酸残基,理论等电点(pI)为9.34,脂肪系数为73.41,平均疏水性为-0.793,相对分子质量为9.86 kD,不稳定指数为73.41,为亲水性、碱性的非跨膜蛋白,无信号肽,定位于细胞核,在第11~63氨基酸处含有1个SANT结构域.GhMYB6蛋白与雷蒙德氏棉GrMYB6聚在同一小分支上,说明二者的亲缘关系较近.GhMYB6基因在V991侵染后6和12 h时相对表达量较对照(未侵染处理,CK)极显著下调(P<0.01),72 h时显著上调(P<0.05,下同),24和48 h时与CK无显著差异(P>0.05).与阴性对照植株TRV:00相比,GhMYB6基因沉默植株萎蔫程度和叶片黄化更严重,病情指数显著升高,茎秆的褐变程度更严重,且茎段在培养基上生长的真菌菌丝数量明显增多.[结论]GhMYB6基因响应黄萎病菌V991侵染,当抑制GhMYB6基因表达后,棉花对黄萎病菌的敏感性增强,抗性明显降低,推测GhMYB6是棉花抗黄萎病防御的一个正向调节因子.
文献关键词:
棉花黄萎病;MYB家族基因;基因克隆;病毒诱导的基因沉默(VIGS);功能验证
中图分类号:
作者姓名:
代培红;胡子曜;李秀青;雷建峰;刘超;刘晓东;李月
作者机构:
新疆农业大学生命科学学院,新疆乌鲁木齐 830052;新疆农业大学农学院/教育部棉花工程研究中心/农业生物技术重点实验室,新疆乌鲁木齐 830052
文献出处:
引用格式:
[1]代培红;胡子曜;李秀青;雷建峰;刘超;刘晓东;李月-.棉花黄萎病相关基因GhMYB6的克隆与功能分析)[J].南方农业学报,2022(11):3020-3027
A类:
GhMYB6,GrMYB6,V991
B类:
棉花黄萎病,功能分析,陆地棉,家族基因,抗病育种,转录组测序,序数,侵染,生物信息学分析,qRT,表达模式,病毒诱导的基因沉默,VIGS,生物学功能,开放阅读框,ORF,bp,氨基酸残基,等电点,pI,疏水性,相对分子质量,kD,亲水性,跨膜蛋白,信号肽,细胞核,SANT,结构域,雷蒙德,一小,亲缘关系,相对表达量,下同,植株,TRV,萎蔫,叶片黄化,病情指数,茎秆,褐变程度,茎段,上生,菌丝,调节因子,基因克隆,功能验证
AB值:
0.286838
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