典型文献
高温胁迫下半夏叶片的转录组分析
文献摘要：
[目的]通过分析高温(38℃)胁迫下半夏(Pinellia ternate)叶片转录组数据,挖掘其响应高温胁迫相关的基因,探究高温胁迫影响半夏的分子机制.[方法]通过Illumina HiSeq测序对高温胁迫处理后的半夏叶片进行转录组分析,并用qRT-PCR技术对DEGs进行验证.[结果]转录组测序共获得38.48 Gb Clean data,与对照组(25℃)相比,高温处理后1138个DEGS上调表达,578个DEGs下调表达.GO富集分析表明,DEGs主要集中在转录因子复合体、内肽酶活性和血红素结合;KEGG富集分析表明,内质网蛋白质加工代谢通路的DEGs最多.基因表达水平分析表明,植物激素信号转导相关基因(PtARP1、PtGRP1、PtABF)、7个谷胱甘肽S转移酶基因PtGST和23个热激蛋白基因PtHSP在高温胁迫下表达量上调.qRT-PCR分析结果表明,9个DEGs在高温胁迫下的差异表达与转录组分析结果一致.[结论]通过对高温胁迫下半夏叶片进行转录组分析,挖掘高温胁迫相关基因,为进一步研究半夏高温胁迫响应机制提供理论参考.
文献关键词：
半夏;高温胁迫;转录组分析;植物激素;热激蛋白
中图分类号：
作者姓名：
郭连安;莫让瑜;谭均;潘媛;陈大霞
作者机构：
重庆市中药研究院,中国中医科学院中药资源中心重庆分中心,重庆市中药良种选育与评价工程技术研究中心,重庆 400065
文献出处：
引用格式：
[1]郭连安;莫让瑜;谭均;潘媛;陈大霞-.高温胁迫下半夏叶片的转录组分析)[J].甘肃农业大学学报,2022(03):84-94
A类：
PtARP1,PtGRP1,PtABF,PtGST,PtHSP
B类：
半夏,转录组分析,Pinellia,ternate,叶片转录组,转录组数据,Illumina,HiSeq,胁迫处理,qRT,DEGs,转录组测序,共获,Gb,Clean,data,高温处理,DEGS,富集分析,复合体,内肽酶,血红素,内质网,蛋白质加工,代谢通路,基因表达水平,表达水平分析,植物激素,激素信号,信号转导,谷胱甘肽,转移酶,酶基因,热激蛋白基因,差异表达,高温胁迫响应,响应机制
AB值：
0.295469
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