典型文献
青花菜高温和盐胁迫相关LncRNAs的鉴定与表达特征分析
文献摘要：
为探讨长链非编码RNA在青花菜高温和盐胁迫中的功能.以青花菜高代自交系'WN12-95B'为试验材料,通过RNA-seq测序、靶基因注释和qRT-PCR分析,筛选出与青花菜高温和盐胁迫相关的LncRNA.在青花菜高温和盐胁迫文库中鉴定到2 432条LncRNAs,筛选获得158个差异LncRNAs,其中96个上调表达,62个下调表达.序列特征分析发现LncRNAs的长度较mRNA短,外显子个数也比mRNA少.靶基因注释显示差异LncRNAs可通过谷胱甘肽代谢、信号转导以及氧化磷酸化等参与青花菜高温和盐胁迫响应.qRT-PCR分析结果显示10个挑选的差异LncRNAs在盐胁迫和高温胁迫中的表达趋势各具特点.XLOC_033957、XLOC_034964、XLOC_005515、XLOC_027154、XLOC_023592 和 XLOC_035830 在高温胁迫下呈现先下降再上升的模式,但在盐胁迫中其表达模式存在差异.XLOC_033671、XLOC_003826、XLOC_06988和XLOC_024730在盐胁迫下呈持续上调表达,在高温胁迫下先上升后下降.通过测序及数据分析,鉴定出青花菜高温和盐胁迫相关的LncRNA的相关基因,为进一步分析LncRNAs在青花菜高温和盐胁迫下的调控机制提供一定的基础.
文献关键词：
青花菜;非生物胁迫;长链非编码RNA;表达特征
中图分类号：
作者姓名：
裴徐梨;荆赞革;唐征;罗天宽
作者机构：
昆明学院农学与生命科学学院,昆明650214;温州科技职业学院农业与生物技术学院,浙江温州325006
文献出处：
引用格式：
[1]裴徐梨;荆赞革;唐征;罗天宽-.青花菜高温和盐胁迫相关LncRNAs的鉴定与表达特征分析)[J].西北农业学报,2022(05):620-627
A类：
WN12,95B
B类：
青花菜,盐胁迫,LncRNAs,表达特征,长链非编码,自交系,seq,靶基因,基因注释,qRT,文库,序列特征分析,外显子,谷胱甘肽代谢,信号转导,氧化磷酸化,胁迫响应,高温胁迫,XLOC,先下,再上,表达模式,先上,调控机制,非生物胁迫
AB值：
0.16643
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