典型文献
多粘类芽孢杆菌LY1的全基因组测序及分析
文献摘要：
为全面了解多粘类芽孢杆菌LY1的遗传背景,利用基因组测序技术全面解析LY1菌株的基因组序列,再通过生物信息学的方法比较不同菌株基因间的差异性和相似性,获得LY1菌株的基因组基本特征、基因功能注释及分类、系统发育进化关系等关键信息,从全基因组水平了解其系统发育进化关系.结果表明:多粘类芽孢杆菌LY1的基因组长度为5 765 474 bp,共有6 086个蛋白质编码基因、162个tRNA基因、42个rRNA基因,GC含量约为45.23％;在GO功能注释中,在生物过程分类下代谢过程和细胞过程中的基因占比最多,分别占比40.77％和38.98％;在细胞组分分类下,分类到细胞和细胞组成中的基因占比最多,为35.18％;在分子功能分类下,分类到催化活性和结合中的基因占比最多,分别为40.34％和35.78％;系统发育进化分析显示,菌株 LY1 与 Paenibacillus polymyxa M1、Paenibacillus polymyxa OSY-DF、Paenibacillus polymyxa SC2、Paenibacillus polymyxa E681等菌株进化距离较近.
文献关键词：
多粘类芽孢杆菌;基因组;测序;基因功能
中图分类号：
作者姓名：
聂俊辉;王平;张立新;王通;郭建军;曾静;袁林
作者机构：
江西省科学院微生物研究所,江西南昌330096;上饶市农林水科学研究中心,江西上饶334000
文献出处：
引用格式：
[1]聂俊辉;王平;张立新;王通;郭建军;曾静;袁林-.多粘类芽孢杆菌LY1的全基因组测序及分析)[J].湖南农业科学,2022(05):1-6
A类：
OSY,E681
B类：
多粘类芽孢杆菌,LY1,全基因组测序,遗传背景,基因组序列,方法比较,基因功能注释,系统发育,进化关系,关键信息,组长,bp,蛋白质编码基因,tRNA,rRNA,生物过程,下代,代谢过程,细胞组成,功能分类,催化活性,进化分析,Paenibacillus,polymyxa,M1,DF,SC2,进化距离
AB值：
0.270859
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
