典型文献
莴苣线粒体基因组密码子使用偏好性分析
文献摘要：
为了分析栽培莴苣Lactuca sativa'Salinas'和野生莴苣Lactuca saligna的线粒体基因组密码子使用特征差异,对2种莴苣的线粒体基因组编码序列进行密码子使用偏好性研究,比较其密码子偏好性形成的影响因素和演化过程.结果表明:栽培莴苣和野生莴苣线粒体编码基因的总GC含量分别为43.43％和42.54％,富含A/T碱基.2种莴苣的有效密码子数(ENC)都在36.61～61.00,密码子偏好性较弱.中性绘图分析表明,2种莴苣线粒体编码基因的第1、2位和第3位碱基GC含量较为保守,选择是影响2种莴苣线粒体基因密码子使用偏好性的主要因素.PR2-plot分析表明,2种莴苣线粒体基因第3位碱基更偏好使用嘧啶碱基.ENC-plot分析结果显示,2种莴苣的线粒体基因密码子偏好性主要受到选择压力影响.对2种莴苣的相对同义密码子使用度(RSCU)分析表明,栽培莴苣和野生莴苣分别有28个和29个高频密码子,除亮氨酸外,2种莴苣的高频密码子均以A/U结尾.2种莴苣线粒体编码基因的密码子使用偏好性总体上较接近,但最优密码子存在较大差异.这种差异可能是因为2种莴苣的低表达基因库差异造成的,也可能与选择压力及人工育种对栽培莴苣线粒体基因组进化的影响有关.
文献关键词：
莴苣;线粒体基因组;密码子偏好性;有效密码子数;最优密码子
中图分类号：
作者姓名：
张扬;孙曙光;李晴;魏珍
作者机构：
河南省农业科学院,河南郑州450002;河南省作物分子育种研究院,河南郑州450002;郑州大学生命科学学院,河南郑州450001
文献出处：
引用格式：
[1]张扬;孙曙光;李晴;魏珍-.莴苣线粒体基因组密码子使用偏好性分析)[J].河南农业科学,2022(10):114-124
A类：
saligna
B类：
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AB值：
0.176007
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