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基于液相色谱-串联质谱的结肠癌血清氧固醇标志物筛选
文献摘要：
结肠癌(CC)是全球常见恶性肿瘤之一,发病率呈逐年上升趋势,目前没有有效的标志物用于疾病早期诊断和干预跟踪.胆固醇及其氧化衍生物氧固醇在众多恶性肿瘤发生发展中发挥关键作用.该研究采用液相色谱?串联质谱(LC?MS/MS)技术,对CC临床血清样本中胆固醇及相关10种氧固醇代谢物进行了定性定量分析,并采用偏最小二乘判别分析(PLS?DA)和正交偏最小二乘判别分析(OPLS?DA)进行多元统计分析,发现上述目标代谢物能够较好地区分CC组与健康对照组.为防止数据过拟合,该研究在PLS?DA模型各代谢物变量投影重要性(VIP)基础上,结合最优组分数及K?均值聚类结果,筛选得到3种代谢标志物.通过受试者操作特征曲线(ROC)的曲线下面积(AUC)分析,发现筛选得到的3种潜在标志物联合预测CC达到0??998,说明模型性能优良.GO(基因本体论)富集分析显示3种潜在标志物主要分布在内质网和包被囊泡上,参与胆固醇代谢、运输、低密度脂蛋白重塑等生物进程,发挥胆固醇运输活性和低密度脂蛋白颗粒受体结合的分子功能.KEGG(京都基因与基因组百科全书)通路分析显示3种潜在标志物富集于类固醇生物合成、PPAR(过氧化物酶体增殖物激活受体)信号通路及ABC(ATP结合盒)转运等通路上.该研究为寻找CC标志物及进一步阐明胆固醇及氧固醇在CC发病过程中的作用奠定了一定的基础.
文献关键词：
液相色谱-串联质谱;结肠癌;氧固醇;代谢组学
中图分类号：
作者姓名：
马占君;李振国;王欢;王仁军;韩晓菲
作者机构：
大连大学生命科学与技术学院,辽宁省糖脂代谢研究重点实验室,大连合成生物学重点实验室,辽宁 大连116622;大连医科大学附属第二医院,辽宁 大连116023
文献出处：
引用格式：
[1]马占君;李振国;王欢;王仁军;韩晓菲-.基于液相色谱-串联质谱的结肠癌血清氧固醇标志物筛选)[J].色谱,2022(06):541-546
A类：
氧固醇
B类：
串联质谱,结肠癌,CC,诊断和干预,衍生物,肿瘤发生发展,LC,血清样本,代谢物,定性定量分析,DA,正交偏最小二乘判别分析,OPLS,多元统计分析,过拟合,变量投影重要性,VIP,均值聚类,选得,代谢标志物,受试者操作特征曲线,潜在标志物,联合预测,模型性能,性能优良,基因本体论,富集分析,内质网,包被,囊泡,泡上,胆固醇代谢,低密度脂蛋白,京都基因与基因组百科全书,通路分析,类固醇,生物合成,PPAR,过氧化物酶体增殖物激活受体,ABC,ATP,代谢组学
AB值：
0.237317
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