典型文献
基于气相色谱-质谱的尿液代谢组学技术结合化学计量学用于戊二酸血症Ⅰ型早期检测研究
文献摘要：
采用气相色谱-质谱联用技术结合化学计量学,针对高维小样本的疾病代谢组学图谱建立高性能的戊二酸血症Ⅰ型(GA-Ⅰ)早期检测模型.基于偏最小二乘判别分析(PLS-DA)的共线性处理和数据解释优势,自助抽样法(Bootstrap)通过数据扰动方式集成多个模型的变量选择能力,挑选出能够持续被筛选的变量实现稳健特征筛选(BS-PLSDA).对于GA-Ⅰ的尿液代谢组学图谱,在两种逐步增大训练集之间样本差异的比例划分(7:3和6:4)下,载荷(LW)、变量投影重要性(VIP)、显著性多元相关(sMC)3种信息向量对应的BS-PLSDA均优于其单独PLS-DA建模的特征变量筛选稳健性.在样本划分比例为7:3时,BS-VIP-PLS?DA的Kuncheva指数高达0.8075.筛选出的稳健特征变量与文献报道的诊断指标一致,不仅真正解释组别间的差异与GA-Ⅰ的代谢机理密切相关,且BS-LW-PLSDA、BS-VIP-PLSDA和BS-sMC-PLSDA展示了良好的预测性能,受试者工作特征曲线下面积均值分别为0.7739、0.8548和0.8471,马修斯相关系数均值分别为0.6719、0.7838和0.8013.与支持向量机递归特征消除法(SVM-RFE)相比,在采用相同的集成特征选择策略下,尽管非线性径向基核函数对应的BS-RBF-SVMRFE可获得高建模性能,但数据解释能力较低.该研究提出的BS-PLSDA可兼顾建模性能和模型解释能力,符合实际临床需求,对GA-Ⅰ早期检测、辅助诊断和疾病机理研究具有很好的指导意义.
文献关键词：
戊二酸血症I型;早期检测;气相色谱-质谱;偏最小二乘判别分析;自助抽样法;稳健特征筛选
中图分类号：
作者姓名：
肖雯;牛芊芊;孙智勇;杨琴;吴本清
作者机构：
长江大学 物理与光电工程学院,湖北 荆州 434023;深圳爱湾医学检验实验室 深圳罕见病代谢组学精准医学工程研究中心,广东 深圳 518000;中国科学院大学 深圳医院,广东 深圳 518000
文献出处：
引用格式：
[1]肖雯;牛芊芊;孙智勇;杨琴;吴本清-.基于气相色谱-质谱的尿液代谢组学技术结合化学计量学用于戊二酸血症Ⅰ型早期检测研究)[J].分析测试学报,2022(11):1577-1583
A类：
稳健特征筛选,sMC,Kuncheva,SVMRFE
B类：
尿液代谢组学,代谢组学技术,技术结合,化学计量学,学用,酸血症,早期检测,联用技术,高维小样本,GA,检测模型,偏最小二乘判别分析,共线性,数据解释,自助抽样法,Bootstrap,数据扰动,扰动方式,变量选择,挑选出,BS,PLSDA,训练集,LW,变量投影重要性,VIP,特征变量,变量筛选,诊断指标,正解,组别,代谢机理,预测性能,受试者工作特征曲线,特征曲线下面积,马修斯,支持向量机递归特征消除,递归特征消除法,特征选择策略,径向基核函数,RBF,模型解释,符合实际,临床需求,辅助诊断,疾病机理
AB值：
0.278263
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