典型文献
古樟端粒基因CcTBP1和CcPOT1的克隆、亚细胞定位及表达分析
文献摘要:
[目的]端粒基因在植物组织衰老和分化过程中发挥着重要的调控作用.本研究通过对古樟端粒基因CcTBP1和CcPOT1进行克隆与生物信息学分析、亚细胞定位及在古樟及其复幼扦插苗中的表达水平检测,初步揭示端粒基因在古樟复幼扦插不定根发生过程中的功能,为探究古樟复幼的端粒调控机理奠定基础.[方法]本研究以1200年树龄的古樟为研究材料,提取叶片RNA,利用PCR和同源克隆相结合的方法克隆端粒基因CcTBP1和CcPOT1,并对其序列进行生物信息学分析;通过构建过表达载体进行亚细胞定位分析;以及通过实时荧光定量(qRT-PCR)分析CcTBP1和CcPOT1在古樟及其复幼扦插苗不同组织和不定根发生过程中的表达模式.[结果](1)克隆获得2个端粒基因,分别命名为CcTBP1和CcPOT1.CcTBP1基因编码序列(CDS)长2163 bp,编码720个氨基酸;CcPOT1基因CDS序列长1407 bp,编码468个氨基酸.(2)序列相似性和系统进化树分析结果显示:CcTBP1蛋白与牛樟RWR76720.1序列相似性高达98%,二者亲缘关系最近;CcPOT1蛋白与牛樟RWR96964.1序列相似性高达99%,二者亲缘关系最近.(3)亚细胞定位分析结果显示:CcTBP1蛋白定位在细胞核中,CcPOT1蛋白定位在细胞质和细胞核中.(4)根茎叶qRT-PCR表达分析发现,CcTBP1基因在古樟根中的表达水平最高,CcPOT1基因在复幼扦插苗根中的表达水平最高.不定根发生过程中的表达分析发现:CcTBP1呈下调表达趋势,在古樟不定根中的表达量高于复幼扦插苗;CcPOT1基因呈上调表达趋势,在古樟不定根中的表达量低于复幼扦插苗.[结论]古樟端粒基因CcTBP1和CcPOT1在古樟复幼不定根发生过程中具有重要的调控功能.
文献关键词:
古樟;端粒基因;克隆;亚细胞定位;表达分析
中图分类号:
作者姓名:
刘立盘;杨爱红;刘腾云;钟永达;周华;余发新
作者机构:
江西省观赏植物遗传改良重点实验室,江西省科学院生物资源研究所,江西南昌330096
文献出处:
引用格式:
[1]刘立盘;杨爱红;刘腾云;钟永达;周华;余发新-.古樟端粒基因CcTBP1和CcPOT1的克隆、亚细胞定位及表达分析)[J].北京林业大学学报,2022(12):1-11
A类:
端粒基因,CcTBP1,CcPOT1,RWR76720,RWR96964
B类:
古樟,亚细胞定位,表达分析,植物组织,衰老,生物信息学分析,扦插苗,水平检测,不定根,调控机理,树龄,同源克隆,过表达载体,定位分析,qRT,不同组织,表达模式,基因编码,编码序列,CDS,bp,系统进化树分析,亲缘关系,蛋白定位,细胞核,细胞质,根茎叶,调控功能
AB值:
0.123624
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