典型文献
8种植物类甜蛋白家族基因进化及密码子特征分析
文献摘要：
类甜蛋白(thaumatin-like proteins,TLP)被归为病程相关蛋白第5家族,在植物防御和生长发育过程中发挥作用.使用Mega X、CodonW及EMBOSS网站在线软件,分析8种植物(莱茵衣藻、小立碗藓、拟南芥、水稻、谷子、高粱、小麦、玉米)类甜蛋白家族进化和密码子使用偏性.结果表明,植物类甜蛋白主要归为10个聚类组,其中聚类组Ⅴ、Ⅵ、Ⅶ中的TLP数目相对较多;5种禾本科作物TLP家族基因主要以G和C作为第3位密码子,密码子具有较强的偏好性,多数类甜蛋白基因ENC值较小,GC3s值分布较集中;8个最优密码子第3位均为G或C结尾,禾本科植物类甜蛋白家族基因密码子偏好G/C结尾.本研究分析了8种植物中类甜蛋白家族基因的进化特征及密码子使用偏性,为该家族基因的分子进化以及转基因应用提供了理论依据.
文献关键词：
类甜蛋白;系统进化;密码子偏性;最优密码子
中图分类号：
作者姓名：
刘潮;韩利红;盛巧;陶雾
作者机构：
曲靖师范学院生物资源与食品工程学院/云南高原生物资源保护与利用研究中心/云南省高校特色果酒技术创新与应用工程研究中心,云南曲靖655011
文献出处：
引用格式：
[1]刘潮;韩利红;盛巧;陶雾-.8种植物类甜蛋白家族基因进化及密码子特征分析)[J].江苏农业科学,2022(10):44-51
A类：
类甜蛋白,thaumatin
B类：
白家,家族基因,基因进化,like,proteins,TLP,病程相关蛋白,植物防御,Mega,CodonW,EMBOSS,莱茵衣藻,小立碗藓,拟南芥,水稻,谷子,高粱,小麦,家族进化,密码子使用偏性,禾本科作物,偏好性,ENC,GC3s,值分布,最优密码子,结尾,禾本科植物,密码子偏好,进化特征,分子进化,转基因,因应,系统进化,密码子偏性
AB值：
0.343888
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
