典型文献
毛蚶容量指数相关基因的转录组学研究
文献摘要：
为筛选不同容量指数毛蚶间的差异基因,寻找毛蚶容量指数性状相关基因.选取容量指数极端值(极大值和极小值)的毛蚶闭壳肌组织进行转录组测序、生物信息分析和差异表达基因功能富集分析.结果表明:各样本转录组测序过滤后共获得20.47×106～25.44×106条有效Reads,有效Reads数据量为6.13～7.62 G,所占比例均超过99.76％;19 493条unigene注释到GO数据库,占比为37.82％;8 548条unigene注释到KEGG数据库中,占比为16.58％.通过差异表达基因功能富集分析发现了大量可能与毛蚶闭壳肌生长相关的基因.GO富集分析显示,5 243个差异基因富集到三大门类中,参与了多个生理过程,如细胞内蛋白质运输、细胞分解代谢、细胞拼接和神经闭壳肌连接处突触生长的调节过程等.391个差异基因显著富集到56 933条代谢通路,如X连锁凋亡抑制蛋白、胆囊收缩素B受体、胃动素受体、ATP-dependent RNA解旋酶、二肽基肽酶3、酸性核糖体磷酸蛋白P1、BSG单克隆抗体和核糖体小亚基蛋白S3e等参与生物的摄食与代谢,可能在毛蚶生长过程中容量指数性状的调控发挥着重要作用.
文献关键词：
毛蚶;容量指数;转录组;生长相关基因
中图分类号：
作者姓名：
冯雅楠;刘惠茹;郭永军;李永仁
作者机构：
天津农学院水产学院,天津市水产生态及养殖重点实验室,天津300392
文献出处：
引用格式：
[1]冯雅楠;刘惠茹;郭永军;李永仁-.毛蚶容量指数相关基因的转录组学研究)[J].经济动物学报,2022(04):283-292
A类：
S3e
B类：
毛蚶,容量指数,转录组学,组学研究,不同容量,差异基因,极端值,极大值,极小值,闭壳肌,肌组织,转录组测序,生物信息分析,差异表达基因,基因功能,功能富集分析,共获,Reads,数据量,unigene,基因富集,大门,门类,生理过程,分解代谢,拼接,经闭,连接处,处突,突触,代谢通路,连锁,胆囊收缩素,胃动素,ATP,dependent,解旋酶,二肽基肽酶,P1,BSG,单克隆抗体,核糖体小亚基,摄食,生长过程,生长相关基因
AB值：
0.350108
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