典型文献
乙酸胁迫条件下酿酒酵母全基因组启动子区组蛋白H4 K16乙酰化修饰分析
文献摘要:
为探究酵母乙酸耐受性的表观遗传调控新机制,采用染色质免疫共沉淀-芯片(Chromatin immunoprecipitation-chip,ChIP-chip)技术,分析乙酸胁迫条件下酿酒酵母全基因组启动子区组蛋白H4K16乙酰化修饰的变化.结果表明,酵母细胞经乙酸胁迫处理(60mmol/L、30min)后,与对照组(添加等体积无菌水)相比,73个酵母基因的启动子区域组蛋白H4K16位点乙酰化修饰发生了改变,乙酰化修饰上升基因19个,主要分布在2、4、5、7、13、15、16号染色体上;乙酰化修饰下降基因54个,主要分布在1、2、4、5、6、7、8、10、11、12、13、14、15、16号染色体上.基因功能分析结果表明,按生物学过程分类乙酰化修饰改变基因主要富集在碱基切除修复、细胞骨架组装、细胞周期进程和含蛋白质的复合物组装;按细胞组分分类乙酰化修饰改变基因主要富集在液泡质子转运V-型ATP酶、DNA聚合酶复合体、质子转运双扇区ATP酶复合物/质子转运域、有丝分裂纺锤体和核染色体;按分子功能分类乙酰化修饰改变基因主要富集在单链DNA 3'—5'外脱氧核糖核酸酶活性、蛋白酶体结合、ATP酶活性/耦联离子跨膜运动.随机选取3个启动子区组蛋白H4K16乙酰化修饰发生差异变化的基因(ATP12、VPS55、DLT1)进行染色质免疫沉淀-实时定量PCR检测,结果与ChIP-chip分析结果一致,验证了 ChIP-chip试验的准确性.综上,酿酒酵母基因启动子区组蛋白H4 K16乙酰化修饰与乙酸耐受性密切相关.
文献关键词:
酿酒酵母;乙酸胁迫;组蛋白H4;乙酰化;染色质免疫共沉淀-芯片
中图分类号:
作者姓名:
马田;王玉婧;程爽;张小华;刘向勇
作者机构:
滨州医学院药学院,山东烟台264003
文献出处:
引用格式:
[1]马田;王玉婧;程爽;张小华;刘向勇-.乙酸胁迫条件下酿酒酵母全基因组启动子区组蛋白H4 K16乙酰化修饰分析)[J].河南农业科学,2022(01):71-78
A类:
乙酸胁迫,H4K16,ATP12,VPS55,DLT1
B类:
胁迫条件,酿酒酵母,全基因组,组蛋白,乙酰化修饰,耐受性,表观遗传调控,染色质免疫共沉淀,Chromatin,immunoprecipitation,chip,ChIP,酵母细胞,胁迫处理,60mmol,30min,加等,无菌水,启动子区域,基因功能分析,生物学过程,碱基切除修复,细胞骨架,细胞周期,复合物,液泡,质子,复合体,双扇,扇区,有丝分裂,纺锤体,功能分类,单链,脱氧核糖核酸,核糖核酸酶活性,蛋白酶体,耦联,异变,染色质免疫沉淀,实时定量,基因启动子区
AB值:
0.202479
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