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典型文献
玉米大斑病菌热激蛋白Hsp70的鉴定和结构分析
文献摘要:
[目的]对玉米大斑病菌Hsp70(Setosphaeria turcicaHsp70,StHsp70)基因家族进行结构鉴定和功能分析,为进一步阐明StHsp70在玉米大斑病菌生长发育和致病过程中的作用奠定基础.[方法]利用玉米大斑病菌基因组数据库获得StHsp70基因家族成员,利用生物信息学方法进行理化性质、亚细胞定位、系统进化、保守基序和结构域分析,构建三级结构模型,并预测启动子等顺式作用元件.[结果]StHsp70基因家族包括11个成员,分别为StHsp70-1~StHsp70-11,多数定位于细胞质,其次为内质网、线粒体和细胞核.系统进化分析结果表明,StHsp70家族成员可分为7类,其中Class A~F分别与酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)热激蛋白SSA、SSB、SSC、KAR2、SSE、SSZ高度同源,而Class G在酵母中未发现其同源蛋白.结构预测分析发现,StHsp70家族成员都含有保守基序Motif 5,而Motif 6只存在于Class A~D中,Class G仅含有2~4种基序,与其他StHsp70家族成员存在显著差异.N端的NBD结构域类型在玉米大斑病菌和酵母不同Hsp70类型间存在显著差异,可能与亚细胞定位有关.不同类型StHsp70的C末端结构和延伸性变化较大,特别是Class G的StHsp70与其他类型具有显著区别,可能与底物的多样性有关.[结论]玉米大斑病菌Hsp70家族11个成员可以分为7类,其中Class G的4个成员在理化性质和结构特征上都与其他成员具有显著的区别,表明StHsp70属于多功能分子伴侣家族.
文献关键词:
玉米大斑病菌;Hsp70;结构分析;功能预测
作者姓名:
张淑红;范永山
作者机构:
唐山师范学院生命科学系/唐山市农业病原真菌与毒素重点实验室,河北 唐山 063000
文献出处:
引用格式:
[1]张淑红;范永山-.玉米大斑病菌热激蛋白Hsp70的鉴定和结构分析)[J].福建农业学报,2022(09):1187-1193
A类:
turcicaHsp70,StHsp70,KAR2
B类:
玉米大斑病菌,热激蛋白,Setosphaeria,基因家族,结构鉴定,功能分析,基因组数据,利用生物,生物信息学方法,亚细胞定位,保守基序,结构域,三级结构,启动子,顺式作用元件,细胞质,内质网,细胞核,系统进化分析,Class,酿酒酵母,Saccharomyces,cerevisiae,SSA,SSB,SSC,SSE,SSZ,同源蛋白,结构预测,预测分析,Motif,NBD,延伸性,底物,性质和结构,分子伴侣,功能预测
AB值:
0.222295
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