植物蔗糖转运体家族蛋白(sucrose transporter,SUC)是介导蔗糖跨膜运输的重要载体.本文基于苦荞幼苗发育过程中转录组测序获得的数据库,筛选鉴定到10个FtSUCs基因,序列长度在1436～7109 bp,编码氨基酸148～605个,其中8个FtSUCs可能定位于内质网,其序列一致性为34.30％,保守位点达到20个.苦荞FtSUCs与拟南芥AtSUCs基因被聚为3类,FtSUCs中4个归入类型Ⅰ,2个归入类型Ⅱ,4个归入类型Ⅲ.苦荞FtSUCs蛋白主要由α-螺旋、不规则卷曲、延长链与β-折叠组成,其中9个FtSUCs包含跨膜结构域.幼苗发育过程中,FtSUCs基因间表达模式存在差异,其中,FtPinG0002608200.01、FtPinG0001943900.01、Ft-PinG0001944100.01在子叶期高表达,FtPinG0000342600.01表达量逐渐提高,FtPinG0001943500.01和Ft-PinG0009584000.01在各时期稳定表达,推测它们可能在不同发育阶段发挥特定功能.苦荞中多个FtSUCs基因存在显著正相关或负相关关系,暗示FtSUCs基因间可能存在协同效应或功能互补,进而共同调控蔗糖的跨膜运输.

苦荞;蔗糖转运体基因;生物信息学;基因表达模式

贵州师范大学 生命科学学院 荞麦产业技术研究中心,贵州 贵阳550001

[1]梁成刚;汪燕;关志秀;韦春玉;邓娇;黄娟;孟子烨;石桃雄-.苦荞蔗糖转运体家族FtSUCs的鉴定与生物信息学分析)[J].浙江农业学报,2022(08):1591-1598

FtSUCs,AtSUCs,FtPinG0002608200,FtPinG0001943900,PinG0001944100,FtPinG0000342600,FtPinG0001943500,PinG0009584000,蔗糖转运体基因

苦荞,生物信息学分析,sucrose,transporter,跨膜运输,幼苗发育,转录组测序,筛选鉴定,bp,内质网,序列一致性,保守位点,拟南芥,归入,卷曲,长链,折叠,跨膜结构域,子叶,稳定表达,发育阶段,暗示,功能互补,同调,基因表达模式

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