典型文献
玉米大斑病菌转录因子StMR1调控的候选靶基因筛选及功能预测
文献摘要：
玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)黑色素调控转录因子1(S.turcica melanin regulation factor 1,StMR1)具有双锌指结构域,通过调控基因表达影响玉米大斑病菌的生长、代谢和致病性,因此,阐明该转录因子的调控模式对解析玉米大斑病菌的致病机理至关重要.本课题组前期研究发现,StMR1基因被敲除后突变体黑色素合成受阻,菌落由黑色变为灰白色,致病力会显著降低.本研究利用玉米大斑病菌野生型菌株和StMR1基因缺失突变体的转录组测序(RNA sequence,RNA-seq)数据筛选差异表达基因,并对其进行基因本体论(Gene Ontology,GO)和KEGG功能注释分析,共筛选获得了1383个上调表达基因和1710个下调表达基因,下调表达基因与分子功能、细胞成分和生物学过程相关,涉及6类25条代谢通路.利用qRT-PCR对筛选获得的6个显著下调表达的基因SETTUDRAFT_172122、SETTUDRAFT_168776、SETTUDRAFT_166944、SETTUDRAFT_162601、SETTUDRAFT_131269和SETTUDRAFT_163249进行了表达量分析,结果发现,6个基因在突变体中的表达水平均呈下调趋势,说明转录因子StMR1对其可能具有正调控作用.生物信息学分析发现,SETTUDRAFT_162601基因具有典型的Catalase结构域,并通过qRT-PCR检测到该基因在H2O2胁迫下表达量显著升高(P<0.05),推测该基因与抗氧化胁迫有关.上述研究结果为深入分析转录因子StMR1调控玉米大斑病菌致病性的机制提供了借鉴,也为解析锌指类转录因子功能提供参考.
文献关键词：
玉米大斑病菌;黑色素;转录因子;黑色素调控转录因子1(MR1)
中图分类号：
作者姓名：
尹玉娟;李海笑;王秋月;贾慧;刘宁;董金皋;曹志艳
作者机构：
河北农业大学植物保护学院 保定071000;华北作物改良与调控国家重点实验室/河北省植物生理与分子病理学重点实验室 保定071000
文献出处：
引用格式：
[1]尹玉娟;李海笑;王秋月;贾慧;刘宁;董金皋;曹志艳-.玉米大斑病菌转录因子StMR1调控的候选靶基因筛选及功能预测)[J].农业生物技术学报,2022(12):2396-2406
A类：
StMR1,SETTUDRAFT
B类：
玉米大斑病菌,靶基因,基因筛选,功能预测,Setosphaeria,turcica,melanin,regulation,锌指,结构域,调控基因,致病性,调控模式,致病机理,前期研究,敲除,突变体,黑色素合成,菌落,色变,灰白色,致病力,研究利用,野生型,基因缺失,缺失突变,转录组测序,sequence,数据筛选,差异表达基因,基因本体论,Gene,Ontology,功能注释,细胞成分,生物学过程,代谢通路,qRT,表达量分析,正调控,生物信息学分析,Catalase,H2O2,氧化胁迫
AB值：
0.238093
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
