沉默信息调节因子1(silent mating type information regulation 2 homolog 1,SIRT1)通过去乙酰化参与脂肪动员、影响脂肪代谢.为探究贵州白山羊(Capra hircus)中SIRT1基因多态性,并筛选与贵州白山羊血清脂代谢指标相关的SNP位点,本研究对SIRT1进行生物信息学分析,分析SIRT1基因在各组织中的表达情况及SNPs与血清中胆固醇、甘油三酯和游离脂肪酸的关联性.结果显示,SIRT1基因在11个组织中均有表达,其中肝脏、背最长肌中的表达量极显著高于其他组织(P<0.01);贵州白山羊SIRT1基因共检测出11个突变位点,均位于1、6外显子上;遗传学分析发现,g.21206621T>C、g.21206920T>G、g.21207071A>C、g.21215871G>A、g.21216960T>C、g.21217717T>C和g.21217777A>G位点PIC均处于中度多态水平,g.21207042C>T、g.21217404T>C突变位点群体基因遗传平衡偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.01);连锁不平衡分析显示,g.21206621T>C、g.21206920T>G、g.21207071A>C、g.21215871G>A、g.21216960T>C、g.21217717T>C、g.21217777A>G位点之间,g.21207042C>T、g.21217404T>C两个位点之间互相存在强连锁不平衡效应;生物信息学分析可知,该蛋白质分子式为C3514H5530N968O1153S26,系非跨膜蛋白,有3个N-糖基化位点,二、三级结构主要以无规则卷曲结构占比最高.g.21206920T>G、g.21207071A>C、g.21216060C>A、g.21216960T>C位点突变后最小自由能不变,其他位点均发生改变.关联性分析发现,g.21206920T>G和g.21217777A>G位点处胆固醇、甘油三酯和游离脂肪酸含量在不同基因型之间差异显著(P<0.05);g.21206621T>C、g.21216960T>C和g.21217717T>C位点处胆固醇、游离脂肪酸含量在不同基因型之间差异显著(P<0.05);g.21207071A>C位点处甘油三酯和游离脂肪酸含量在不同基因型之间差异显著(P<0.05);游离脂肪酸在g.21215871G>A位点处不同基因型之间差异显著(P<0.05).本研究结果表明,SIRT1基因可作为贵州白山羊脂肪代谢与沉积的候选分子标记,为明确SIRT1基因调控脂肪代谢的相关位点和开展山羊遗传标记提供了理论参考.

沉默信息调节因子1(SIRT1);单核苷酸多态性;贵州白山羊;总胆固醇;甘油三酯;游离脂肪酸

惠茂茂;陈祥;阮涌;李世军;周志楠;杨沛方;张艳

贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室,贵阳550025;贵州大学动物科学学院,贵阳550025

农业生物技术学报

[1]惠茂茂;陈祥;阮涌;李世军;周志楠;杨沛方;张艳-.贵州白山羊SIRT1基因组织表达及其多态性与血清脂代谢指标的关联性分析)[J].农业生物技术学报,2022(08):1534-1546

21206621T,21206920T,21207071A,21215871G,21216960T,21217717T,21217777A,21207042C,21217404T,C3514H5530N968O1153S26,21216060C

贵州白山羊,SIRT1,组织表达,脂代谢指标,关联性分析,沉默信息调节因子,silent,mating,type,information,regulation,homolog,去乙酰化,脂肪代谢,Capra,hircus,基因多态性,羊血,生物信息学分析,SNPs,甘油三酯,游离脂肪酸,背最长肌,他组织,突变位点,外显子,遗传学分析,PIC,基因遗传,遗传平衡,Hardy,Weinberg,平衡状态,连锁不平衡分析,个位,分子式,跨膜蛋白,糖基化位点,三级结构,无规则,卷曲结构,位点突变,自由能,脂肪酸含量,不同基因型,羊脂,分子标记,基因调控,遗传标记,单核苷酸多态性,总胆固醇

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