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典型文献
CIDEA基因上游调控区变异对猪肌内脂肪性状的影响
文献摘要:
[目的]本文旨在鉴定诱导细胞死亡DNA片段化因子α样效应因子A(CIDEA)基因上游调控区内与猪肌内脂肪沉积相关的单核苷酸多态性(SNP)位点,并分析关联位点对基因表达的影响,为解析CIDEA基因对猪肌内脂肪性状的影响机制提供参考.[方法]通过对猪CIDEA上游调控区2 kb片段测序,挖掘出肌内脂肪含量相关的候选SNP位点,在杜洛克×长白猪×大白猪群体中对候选位点进行关联分析;通过荧光定量PCR检测关联位点不同基因型个体的CIDEA基因表达量和肌内脂肪标记基因脂肪酸结合蛋白4基因(FABP4)、脂肪酸结合蛋白3基因(FABP3)的表达量;双荧光素酶报告基因系统分析突变位点对CIDEA基因转录活性的影响.[结果]猪CIDEA基因上游调控区包含6个SNP位点,连锁分析后选择g.97268816 T>A、g.97269217 G>A和g.97269353 C>T 3个标签SNP位点进行关联分析,发现g.97268816 T>A位点中AA基因型个体的肌内脂肪含量显著高于TT基因型个体(P<0.05),而g.97269217 G>A和g.97269353 C>T位点中3种基因型个体之间的肌内脂肪含量差异不显著(P>0.05).g.97268816 T>A位点中AA基因型个体的CIDEA基因表达水平显著高于TT基因型个体(P<0.05),而FABP4基因表达水平则显著高于TT基因型个体(P<0.01)和TA基因型个体(P<0.05).双荧光素酶报告基因活性的结果显示AA型个体的荧光素酶活性极显著高于TT型个体(P<0.01).[结论]CIDEA基因上游调控区g.97268816 T>A位点与猪的肌内脂肪含量显著相关,突变可以导致CIDEA基因的表达水平升高,进而影响猪的肌内脂肪含量.
文献关键词:
CIDEA;猪;肌内脂肪;变异;转录活性
作者姓名:
杨凯;魏雨辰;吴望军;钮莹芳;邱启勇;邵勇钢;翟曼君;董新星;韦伟;陈杰;张立凡
作者机构:
南京农业大学动物科技学院,江苏 南京210095;新疆农业大学动物科学学院,新疆 乌鲁木齐830052;云南农业大学动物科学技术学院,云南 昆明650201
引用格式:
[1]杨凯;魏雨辰;吴望军;钮莹芳;邱启勇;邵勇钢;翟曼君;董新星;韦伟;陈杰;张立凡-.CIDEA基因上游调控区变异对猪肌内脂肪性状的影响)[J].南京农业大学学报,2022(03):570-577
A类:
CIDEA
B类:
脂肪性,细胞死亡,片段化,效应因子,肌内脂肪沉积,沉积相,单核苷酸多态性,SNP,kb,挖掘出,肌内脂肪含量,杜洛克,长白猪,大白猪,猪群,不同基因型,基因表达量,标记基因,脂肪酸结合蛋白,FABP4,FABP3,双荧光素酶报告基因,突变位点,基因转录,转录活性,连锁分析,后选择,点中,AA,TT,含量差异,基因表达水平,TA,荧光素酶活性
AB值:
0.201719
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