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典型文献
地黄全长转录组分析及毛蕊花糖苷生物合成下游途径关键酶基因的挖掘与解析
文献摘要:
为研究毛蕊花糖苷生物合成下游途径,本文采用基于单分子测序技术对地黄进行全长转录组测序.结果 得到26.61 Gb数据,96548条高质量一致序列,61262条非冗余转录本序列,共鉴定出3070个可变剪接,34013个SSR,4241个lncRNA,46412个完整CDS序列,56633个转录本注释NR、GO和KEGG等数据库,有326条转录本注释到毛蕊花糖苷合成途径中.实时荧光定量PCR结果揭示毛蕊花糖苷生物合成下游途径关键酶基因URT、CCCT和HCT在高毛蕊花糖苷含量的野生地黄中高表达,且均对MeJA诱导存在"V"型响应趋势.
文献关键词:
地黄;全长转录组;毛蕊花糖苷;代谢途径
作者姓名:
周延清;邵露营;李慧敏;朱佳琳
作者机构:
河南师范大学生命科学学院,河南新乡453007
文献出处:
引用格式:
[1]周延清;邵露营;李慧敏;朱佳琳-.地黄全长转录组分析及毛蕊花糖苷生物合成下游途径关键酶基因的挖掘与解析)[J].植物生理学报,2022(01):197-206
A类:
CCCT
B类:
转录组分析,毛蕊花糖苷,生物合成,关键酶基因,单分子测序技术,全长转录组测序,Gb,非冗余,转录本,可变剪接,SSR,lncRNA,CDS,NR,合成途径,URT,HCT,生地黄,MeJA,代谢途径
AB值:
0.261724
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