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三叶木通转录组分析及三萜皂苷生物合成途径关键酶基因的发掘
文献摘要:
为了解三叶木通(Akebia trifoliata(Thunb.)Koidz.)的三萜皂苷合成途径及其关键酶,本研究对其花、叶、根、茎进行转录组测序,组装获得了 57.25 Gb数据,含 140 859个unigenes,序列平均长度为1350 bp.KEGG代谢通路富集结果显示,517个unigenes参与三萜皂苷合成相关的3条代谢途径,其中415个unigenes编码三萜皂苷生物合成途径的19个关键酶.对三萜皂苷生物合成过程中的关键酶角鲨烯环氧酶(SE)进行序列分析和同源建模,发现其具有保守的底物结合结构域.将三叶木通茎与花、叶、根的基因表达水平进行比较,发现茎与根相比较其上调基因数目最多,其中295个差异表达基因(DEGs)与三萜皂苷生物合成途径相关.
文献关键词:
三叶木通;转录组测序;三萜皂苷;生物合成;角鲨烯环氧酶
中图分类号:
作者姓名:
钱程程;赵历强;杨亚湉;韩邦兴;吴家文;欧金梅
作者机构:
安徽中医药大学药学院,合肥230012;安徽中医药大学科研实验中心,新安医学教育部重点实验室,合肥230038;皖西学院生物与制药工程学院,安徽六安237012;中药饮片制造新技术安徽省重点实验室,合肥230012
文献出处:
引用格式:
[1]钱程程;赵历强;杨亚湉;韩邦兴;吴家文;欧金梅-.三叶木通转录组分析及三萜皂苷生物合成途径关键酶基因的发掘)[J].植物科学学报,2022(03):378-389
A类:
B类:
三叶木通,转录组分析,三萜皂苷生物合成,生物合成途径,关键酶基因,Akebia,trifoliata,Thunb,Koidz,转录组测序,Gb,unigenes,平均长度,bp,代谢通路,通路富集,集结,代谢途径,合成过程,角鲨烯环氧酶,SE,序列分析,同源建模,底物,结合结构,结构域,基因表达水平,差异表达基因,DEGs
AB值:
0.260734
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