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基于转录物组学的大肠杆菌血红素过氧化物酶EfeB的生理功能解析
文献摘要：
大肠杆菌血红素过氧化物酶EfeB属于染料脱色过氧化物酶超家族.该家族的酶类一般具有良好的合成染料降解能力,但是其在生物体内的功能尚不清楚.为了深入研究EfeB的生理功能,本文通过同源重组的方法构建了efeB敲除菌株Eco△efeB,比较了亲本菌株E.coli BL21和Eco△efeB在基因组转录水平上、不同条件下的细胞生长以及对铁离子应答上的差异.结果表明:efeB基因的缺失引起了菌体1 765个基因的差异表达,这些基因主要与菌体的细胞代谢途径、细胞膜合成和鞭毛运动有关;在pH为7.0时,BL21和Eco△efeB的生长无显著差异,但在pH4.5时BL21的生长明显优于Eco△efeB,efeB基因的功能性表达可以支持大肠杆菌在低pH下的生存;当培养环境中有Fe2+存在时,efeB显著上调.以上结果为EfeB生理功能的认知和利用提供了一定的理论依据.
文献关键词：
大肠杆菌;过氧化物酶;EfeB;RNA-seq;铁代谢
中图分类号：
作者姓名：
刘琪;刘海峰;冯超群;王悦;张鑫;卢杰;唐蕾
作者机构：
江南大学工业生物技术教育部重点实验室,江苏无锡214122;江南大学生物工程学院,江苏无锡214122
文献出处：
引用格式：
[1]刘琪;刘海峰;冯超群;王悦;张鑫;卢杰;唐蕾-.基于转录物组学的大肠杆菌血红素过氧化物酶EfeB的生理功能解析)[J].中国生物化学与分子生物学报,2022(06):772-777
A类：
EfeB,efeB
B类：
转录物组,大肠杆菌,血红素过氧化物酶,生理功能,功能解析,染料脱色,超家族,酶类,合成染料,染料降解,降解能力,生物体,同源重组,敲除,除菌,Eco,亲本,coli,BL21,转录水平,不同条件下,细胞生长,铁离子,离子应答,菌体,差异表达,细胞代谢,代谢途径,细胞膜,鞭毛,pH4,长明,培养环境,Fe2+,seq,铁代谢
AB值：
0.312087
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