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典型文献
铜绿假单胞菌寡核苷酸酶的纯化、结晶和活性验证
文献摘要:
目的:研究致病菌铜绿假单胞菌寡核苷酸酶(PaOrn)的三维结构和体外水解活性,验证PaOrn活性位点并探讨PaOrn对铜绿假单胞菌(P.aeruginosa)胞内3',5'-环二鸟苷(c-di-GMP)水平和致病毒性的影响.方法:构建重组质粒pET 32M3C-PaOrn,在大肠杆菌(E.coli)BL21中诱导表达目的蛋白,获得组氨酸(His)标签和谷胱甘肽(GST)标签标记.采用多级纯化方法纯化蛋白,经Ni亲和层析、GST亲和层析和阴离子交换层析后获得高纯度和高均一性PaOrn目的蛋白.采用商业化结晶试剂和坐滴法筛选晶体,根据晶体状态进一步优化.采用X射线衍射法验证晶体质量,分辨率高于3?时用于结构解析.采用高分辨质谱技术Q TOF验证PaOrn蛋白水解底物二鸟苷磷酸(pGpG)活性,鸟苷单磷酸(GMP)产物作为验证活性的指标.采用尿素聚丙烯酰胺(Urea-PAGE)法验证PaOrn蛋白和点突变PaOrn蛋白(OrnD11A、OrnE13A、OrnD111A、OrnH157A和OrnD162A)对10 nt长度寡核苷酸RNA的水解活性,降解条带作为活性正常的分析指标.结果:经原核系统表达和多级纯化,得到纯度高达95%的目的蛋白PaOrn.于结晶试剂WizardⅠ#12[1.0 mmol·L-1(NH4)2HPO4,0.1 mmol·L-1 Imidazole]pH 8.0条件下生长出质量较好的单晶,晶体PaOrn的分辨率为1.85?,复合物PaOrn-GMP和PaOrnD11A-pGpG的分辨率分别为1.90?和1.70?.高分辨质谱,PaOrn将底物pGpG水解为GMP.尿素聚丙烯酰胺凝胶电泳,PaOrn可降解长达10 nt的RNA,当活性位点Asp11、Glu13、Asp111、His157和Asp162分别突变后,PaOrn丧失活性,无法降解底物pGpG和RNA(10 nt).结论:PaOrn通过降解寡核苷酸参与调控胞内c-di-GMP和RNA水平,影响转录起始和细胞多种生物学行为.
文献关键词:
铜绿假单胞菌;寡核苷酸酶;3’;5’-环二鸟苷;蛋白纯化;晶体筛选
作者姓名:
张建羽;张琼林
作者机构:
南开大学生命科学学院生物化学与分子生物学系,天津 300071
引用格式:
[1]张建羽;张琼林-.铜绿假单胞菌寡核苷酸酶的纯化、结晶和活性验证)[J].吉林大学学报(医学版),2022(05):1124-1130
A类:
寡核苷酸酶,PaOrn,32M3C,pGpG,OrnD11A,OrnE13A,OrnD111A,OrnH157A,OrnD162A,#12,PaOrnD11A,Asp11,Glu13,Asp111,His157,Asp162
B类:
铜绿假单胞菌,活性验证,致病菌,三维结构,外水,水解活性,活性位点,aeruginosa,鸟苷,di,GMP,病毒性,重组质粒,pET,大肠杆菌,coli,BL21,诱导表达,目的蛋白,组氨酸,谷胱甘肽,GST,纯化方法,亲和层析,阴离子交换层析,高纯度,均一性,衍射法,晶体质量,分辨率高,结构解析,高分辨质谱,质谱技术,TOF,蛋白水解,底物,单磷酸,Urea,PAGE,点突变,nt,条带,分析指标,原核,Wizard,NH4,2HPO4,Imidazole,单晶,复合物,聚丙烯酰胺凝胶电泳,可降解,长达,失活,录起,生物学行为,蛋白纯化,晶体筛选
AB值:
0.238945
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