典型文献
基于叶绿体全基因组序列的双峰法鉴定粗茎秦艽及其近缘物种
文献摘要：
粗茎秦艽Gentiana crassicaulis Duthie ex Burk.为中药"秦艽"的基原植物之一,而同为龙胆属秦艽组的西藏秦艽 Gentiana tibetica King ex Hook.f.、粗壮秦艽 Gentiana robusta King ex Hook.f.为其近缘的非国家药典品种.因存在较大的种内形态变异,粗茎秦艽与西藏秦艽、粗壮秦艽间表现出较高的形态相似性,且存在一定的同域分布,为粗茎秦艽的鉴定带来了一定的难度.为有效鉴定中药秦艽国家药典品种粗茎秦艽与其近缘的非药典品种,本文基于前期测定的粗茎秦艽、粗壮秦艽叶绿体基因组序列,首次测定西藏秦艽叶绿体基因组序列,筛选分子标记并构建这三个物种的分子鉴定方法.结果如下:① 获得西藏秦艽叶绿体基因组序列,长度为148 765 bp,大单拷贝区(LSC)、小单拷贝区(SSC)分别为81 163 bp和17 070 bp,反向重复区(IR)为25 266 bp;② 粗茎秦艽、西藏秦艽、粗壮秦艽的叶绿体基因组结构一致;粗茎秦艽与西藏秦艽的重复序列、SSR分布情况一致,两个物种间叶绿体基因组变异位点数仅为9;③ 筛选同时对这三个物种有效鉴定的单核苷酸多态性位点(SNP),并验证稳定性;④ 建立SNP双峰检测方法,对各物种及混合样品进行有效鉴定.本工作可为粗茎秦艽及其近缘物种的DNA分子鉴定,以及相关藏药品种的整理等工作提供基础资料.
文献关键词：
粗茎秦艽;西藏秦艽;粗壮秦艽;叶绿体基因组;SNP标记;双峰检测法
中图分类号：
作者姓名：
高娜娜;倪梁红;赵志礼;嘎务
作者机构：
上海中医药大学,上海201203;西藏藏医药大学,西藏拉萨850000
文献出处：
引用格式：
[1]高娜娜;倪梁红;赵志礼;嘎务-.基于叶绿体全基因组序列的双峰法鉴定粗茎秦艽及其近缘物种)[J].药学学报,2022(08):2520-2527
A类：
西藏秦艽,粗壮秦艽,双峰检测法
B类：
叶绿体全基因组,全基因组序列,双峰法,粗茎秦艽,近缘,Gentiana,crassicaulis,Duthie,ex,Burk,基原,龙胆属,tibetica,King,Hook,robusta,非国家,药典,种内,形态变异,形态相似,同域分布,叶绿体基因组,定西,分子标记,分子鉴定,鉴定方法,bp,拷贝,LSC,SSC,重复区,基因组结构,重复序列,SSR,种间,基因组变异,变异位点,单核苷酸多态性位点,SNP,混合样品,藏药,基础资料
AB值：
0.237371
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