典型文献
烟草Trihelix转录因子家族鉴定及表达分析
文献摘要：
运用生物信息学分析方法,通过对烟草(Nicotiana tabacum)全基因组数据中的Trihelix家族基因的理化性质、染色体分布、染色体共线性、基序组成、基因结构、顺式作用元件及其低温处理下的表达进行完整的鉴定分析,初步解析烟草Trihelix家族成员的结构与功能.从普通烟草中鉴定出32个Trihelix基因,分为GT-1、GT-2、GTγ、SH4、SIP1等5个亚家族;32个NtTH基因有着10种分布不均匀的基序,且有不同的基因结构,但在同一个亚家族内有相似性;烟草与番茄(Lycopersicon esculentum)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)存在同源的Trihelix基因,普通烟草Trihelix家族自身也存在共线性基因;鉴定出13种不同类型的顺式元件,主要与非生物胁迫、激素和生长发育有关,其中ABRE和MeJA是最多的两个顺式元件,表明NtTH基因的功能主要与非生物胁迫和生长发育响应调控有关;烟草NtTH3和NtTH16等11个基因在对低温胁迫的响应方面有着重要作用.本研究挖掘到与烟草抗冷有关的基因,为烟草抗冷性遗传改良提供了理论依据.
文献关键词：
烟草;Trihelix转录因子家族;抗冷性;非生物胁迫
中图分类号：
作者姓名：
李栋成;李魁印;韦兴启;段丽丽;莫泽君;刘仁祥
作者机构：
贵州大学烟草学院/贵州省烟草品质研究重点实验室,贵州 贵阳 550025;安顺学院农学院,贵州 安顺 561000;黔南州烟草公司长顺县分公司,贵州 长顺 550700
文献出处：
引用格式：
[1]李栋成;李魁印;韦兴启;段丽丽;莫泽君;刘仁祥-.烟草Trihelix转录因子家族鉴定及表达分析)[J].亚热带植物科学,2022(01):1-12
A类：
NtTH,NtTH3,NtTH16
B类：
Trihelix,表达分析,生物信息学分析,Nicotiana,tabacum,全基因组,基因组数据,家族基因,共线性,基序,基因结构,顺式作用元件,低温处理,鉴定分析,结构与功能,普通烟草,GT,SH4,SIP1,亚家族,分布不均匀,同一个,番茄,Lycopersicon,esculentum,拟南芥,Arabidopsis,thaliana,水稻,Oryza,sativa,非生物胁迫,ABRE,MeJA,响应调控,低温胁迫,抗冷性,遗传改良
AB值：
0.353451
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
