典型文献
碎米荠超氧化物歧化酶基因家族成员的鉴定和分析
文献摘要：
为了解碎米荠(Cardamine hirsuta)的SOD基因特征,对SOD家族成员的基因结构、染色体定位、系统进化关系进行了分析,对顺式作用元件和蛋白结构进行了预测,并利用qRT-PCR技术检测各家族成员的组织表达模式.结果表明,碎米荠基因组中共有10个SOD基因(ChSODs),包括6个Cu/Zn-SOD、3个Fe-SOD和1个Mn-SOD.编码的ChSODs蛋白有57～324个氨基酸,分子量为6419.41～34659.01 kDa,理论等电点为4.92～9.60;系统进化树分析表明,碎米荠的ChSOD与拟南芥的AtSOD的同源性较高;ChSODs在根、茎、叶中均有表达,且在叶中高表达,其中CARHR085500和CARHR256690在叶和茎中表达量较高;顺式作用元件预测表明,碎米荠SOD响应多种非生物胁迫,其中对ABA和低温胁迫较为敏感;ChSODs蛋白质的二级和三级结构具有差异性.这表明碎米荠SOD基因在抗氧化过程中发挥重要作用.
文献关键词：
碎米荠;SOD;基因家族
中图分类号：
作者姓名：
付伟;李林;康宇;龙澜;杨永康;殷红清;向极钎;梅磊
作者机构：
恩施土家族苗族自治州农业科学院,湖北 恩施 445000;湖北省富硒产业技术研究院,湖北 恩施 445000;中国科学院植物研究所,北京 100093
文献出处：
引用格式：
[1]付伟;李林;康宇;龙澜;杨永康;殷红清;向极钎;梅磊-.碎米荠超氧化物歧化酶基因家族成员的鉴定和分析)[J].热带亚热带植物学报,2022(03):301-310
A类：
ChSODs,ChSOD,AtSOD,CARHR085500,CARHR256690
B类：
碎米荠,酶基因,基因家族,Cardamine,hirsuta,基因特征,基因结构,染色体定位,进化关系,顺式作用元件,蛋白结构,qRT,各家,组织表达模式,Mn,分子量,kDa,等电点,系统进化树分析,拟南芥,同源性,叶和茎,非生物胁迫,ABA,低温胁迫,三级结构,氧化过程
AB值：
0.26
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