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毛竹C4H基因的鉴定及其表达模式分析
文献摘要：
为了解毛竹(Phyllostachys edulis)中肉桂酸-4-羟化酶基因(C4H)的分子特征及其表达模式,采用生物信息学方法在毛竹基因组数据库中鉴定出6个C4H成员(PeC4H1～PeC4H6),基因编码区长度为1506～1695 bp,推测编码501～564 aa,均具有保守的血红素结合域、苏氨酸结合槽基序和5个特征性底物识别位点,属于细胞色素P450超家族.系统进化分析表明,6个PeC4Hs可分为2类,分别含有2和4个成员.转录组数据分析表明,PeC4Hs在毛竹26个组织中的表达量存在明显差异,不同高度笋中PeC4Hs的表达差异显著.PeC4Hs启动子序列中含有多种响应逆境胁迫和激素信号的顺式调控元件,PeC4Hs表达受干旱和GA3的影响,干旱时,仅PeC4H3/4在根中显著上调表达,其余成员均呈下调表达;GA3处理下叶中PeC4H3/6迅速响应,呈先显著上调后逐渐降低的趋势,根中PeC4H2/5在处理前1 h短暂下调后又显著上调,至8 h时恢复到处理前的表达水平.因此,PeC4Hs可能在毛竹笋的木质化过程和应对非生物胁迫中发挥着重要作用.
文献关键词：
毛竹;肉桂酸-4-羟化酶;生物信息;基因表达
中图分类号：
作者姓名：
李广柱;朱成磊;杨克彬;王新悦;高志民
作者机构：
国际竹藤中心竹藤资源基因科学与基因产业化研究所,国家林业和草原局/北京市共建竹藤科学与技术重点实验室,北京 100102
文献出处：
引用格式：
[1]李广柱;朱成磊;杨克彬;王新悦;高志民-.毛竹C4H基因的鉴定及其表达模式分析)[J].热带亚热带植物学报,2022(02):151-160
A类：
PeC4H1,PeC4H6,PeC4Hs,PeC4H3,PeC4H2
B类：
表达模式分析,Phyllostachys,edulis,肉桂酸,羟化酶,酶基因,分子特征,生物信息学方法,基因组数据,基因编码,编码区,区长,bp,aa,血红素,苏氨酸,基序,特征性,底物识别位点,细胞色素,P450,超家族,系统进化分析,转录组数据,不同高度,表达差异,启动子序列,逆境胁迫,激素信号,顺式调控元件,GA3,下叶,到处,毛竹笋,木质化,非生物胁迫
AB值：
0.312523
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