典型文献
新疆地区GIII.2型牛诺如病毒流行病学调查及ORF1基因遗传进化分析
文献摘要:
为调查牛诺如病毒(BNoV)在新疆不同地区牛场中的感染情况,本实验针对BNoV的RdRp基因设计特异性引物,采用RT-PCR方法对新疆乌鲁木齐、塔城、伊犁、喀什4个地区的7个牛场共230份牛粪便样品进行检测,并获得塔城地区一株BNoV开放阅读框1(ORF1)基因,对其进行遗传进化、同源性及基因重组分析.流行病学调查结果显示,新疆地区BNoV阳性率为17.83%(41/230),其中塔城地区阳性率最高(60.00%,9/15).对检测的BNoV ORF1基因进行遗传进化分析,结果显示,其属于GIII.2型BNoV,与中国四川地区OK032546.1病毒株相似性最高(94.6%),聚为一支;同源性分析结果显示,本研究中检测到的两株BNoV的ORF1基因序列之间的同源性为100%,均与OK032546.1病毒株相应基因序列同源性最高(96.6%).ORF1编码的氨基酸序列分析显示两株BNoV ORF1与MZ573179.1病毒株同源性最高(98.35%),且与国内外其他GIII.2型病毒株同源性在76.1%以上.通过对ORF1基因重组分析,结果显示,本研究检测到的BNoV与国内外经典株ORF1基因无基因重组现象.本研究填补了新疆地区对BNoV基因序列研究的空白,为BNoV感染的防制提供了参考依据.
文献关键词:
牛诺如病毒;感染情况;ORF1基因;遗传进化分析
中图分类号:
作者姓名:
马志刚;何琴;施晨阳;刘馨博;郭雪萍;吴静;马英才;苏战强;钟旗;姚刚;马雪连
作者机构:
新疆农业大学动物医学学院,新疆 乌鲁木齐 830052;新疆畜牧科学院兽医研究所,新疆 乌鲁木齐 830052
文献出处:
引用格式:
[1]马志刚;何琴;施晨阳;刘馨博;郭雪萍;吴静;马英才;苏战强;钟旗;姚刚;马雪连-.新疆地区GIII.2型牛诺如病毒流行病学调查及ORF1基因遗传进化分析)[J].中国预防兽医学报,2022(08):888-891,902
A类:
GIII,OK032546,MZ573179
B类:
新疆地区,牛诺如病毒,流行病学调查,ORF1,基因遗传,遗传进化分析,BNoV,牛场,感染情况,RdRp,特异性引物,乌鲁木齐,伊犁,喀什,牛粪,粪便样品,塔城地区,一株,开放阅读框,基因重组,重组分析,国四,四川地区,毒株,同源性分析,两株,基因序列,序列同源性,氨基酸序列,序列分析,外经,经典株,防制
AB值:
0.229686
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