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典型文献
2020年福建省龙岩市水禽坦布苏病毒检测及其NS5基因变异分析
文献摘要:
为了解龙岩市水禽坦布苏病毒(ATV)感染情况及其NS5基因遗传变异情况,对采自福建省龙岩市7个县(市、区)农贸市场、规模化禽场和散养户的鸭泄殖腔棉拭子2885份、鹅泄殖腔棉拭子样品320份进行ATV RT-PCR检测,并对部分阳性样品进行病毒分离鉴定及NS5基因序列测定与遗传进化分析.结果显示:ATV总阳性率为17.19%(551/3205),其中鸭、鹅样品阳性率分别为16.81%(485/2885)、20.63%(66/320),差异显著(P<0.01);按不同场所统计,散养户水禽样品ATV阳性率最高(20.68%,304/1470),农贸市场次之(15.19%,224/1475),规模化养殖场最低(8.85%,23/260),相互间差异显著(P<0.01);按被检水禽日龄统计,90~<180日龄水禽样品阳性率最高(21.29%,397/1865),180~<380日龄次之(17.62%,74/420),30日龄内最低(4.44%,4/90);春季水禽样品阳性率(22.74%,362/1592)明显高于秋节(11.72%,189/1613).将部分ATV阳性样品经鸭胚分离培养,共分离出13株鸭源、鹅源ATV毒株.对这13株分离株NS5基因片段进行核苷酸序列分析发现,其同源性高达98.6%~100%,与国内ATV代表株核苷酸序列同源性介于96.5%~99.7%,且处于同一进化树分支,而与澳大利亚等国外分离株亲缘关系较远.结果表明,目前福建省龙岩市鸭、鹅等水禽中存在不同程度的ATV感染,流行毒株仍为国内当前流行毒株,未出现明显变异.本研究了解了该地区ATV的流行特点及基因遗传进化情况,为制定ATV感染防控措施提供了依据.
文献关键词:
禽坦布苏病毒;病原检测;NS5基因;水禽;福建
作者姓名:
陈长福
作者机构:
龙岩市动物疫病预防控制中心,福建龙岩 364000
文献出处:
引用格式:
[1]陈长福-.2020年福建省龙岩市水禽坦布苏病毒检测及其NS5基因变异分析)[J].中国动物检疫,2022(09):47-53
A类:
B类:
福建省龙岩市,水禽,禽坦布苏病毒,病毒检测,NS5,基因变异,变异分析,ATV,感染情况,基因遗传变异,变异情况,农贸市场,散养户,泄殖腔,子样,病毒分离鉴定,基因序列,序列测定,遗传进化分析,样品阳性率,同场,场次,规模化养殖场,相互间,日龄,秋节,分离培养,分离株,序列分析,代表株,序列同源性,进化树,外分,亲缘关系,较远,流行毒株,流行特点,感染防控,病原检测
AB值:
0.263237
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