典型文献
2016-2020年华北地区猪繁殖与呼吸综合征病毒分子流行病学调查
文献摘要:
利用RT-PCR方法对2016-2020年华北地区692份疑似猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)临床样本进行检测,获得368份阳性样品,阳性率为53.18%,并对其进行了ORF5基因扩增和测序,开展遗传变异和分子流行病学分析.结果 显示,共获得33条完整的ORF5基因序列,除了HB-XT株为600 bp,其余全长均为603 bp.ORF5基因遗传进化分析表明33株均为Ⅱ型,其中有9株分布在Lineage 8,24株分布在Lineage 1.33株之间的氨基酸序列同源性为80.1%~99.5%,与JX-A1株和NADC30株的同源性分别为81.1%~99.5%和85.6%~94.5%.氨基酸分析结果表明,33株均在诱骗表位和中和表位发现了突变;在33株中共发现7个N-糖基化位点,其中包括相对保守的N44和N51位点,以及主要位于抗原袁位的N30,N32,N33,N34和N35位点.结果 表明,2016-2020年华北地区HP-PRRSV毒株逐渐被类NADC30毒株所取代,成为优势毒株,且ORF5基因变异差异较大,使PRRSV流行变得更加复杂.因此,本研究对PRRS分子流行病学以及疫苗的选择和防控具有重要的意义.
文献关键词:
猪繁殖与呼吸综合征病毒;ORF5基因;遗传变异分析;华北地区;分子流行病学
中图分类号:
作者姓名:
王丙雷;王晶;刘媛;陈少杰;顾文源;郭禹;范京惠;左玉柱
作者机构:
河北农业大学动物医学院,河北保定071001;河北省兽医生物技术创新中心,河北保定071001;邢台市邢东新区动物卫生监督所,河北邢台054001
文献出处:
引用格式:
[1]王丙雷;王晶;刘媛;陈少杰;顾文源;郭禹;范京惠;左玉柱-.2016-2020年华北地区猪繁殖与呼吸综合征病毒分子流行病学调查)[J].中国兽医学报,2022(01):12-19
A类:
N44,N51,N34
B类:
年华,华北地区,猪繁殖与呼吸综合征病毒,分子流行病学,流行病学调查,临床样本,ORF5,基因扩增,流行病学分析,共获,基因序列,HB,XT,bp,全长,基因遗传,遗传进化分析,Lineage,氨基酸序列,序列同源性,JX,A1,NADC30,氨基酸分析,诱骗,中和表位,糖基化位点,N30,N32,N33,N35,HP,PRRSV,毒株,基因变异,遗传变异分析
AB值:
0.308208
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