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牛呼吸道合胞体病毒G蛋白特异性核酸适配体的筛选及初步应用
文献摘要:
为筛选牛呼吸道合胞体病毒(BRSV)G蛋白特异性核酸适配体,本研究通过原核系统表达G蛋白,并利用软件设计引物,由公司合成初始寡核苷酸文库,并利用微孔板法,经过包被G蛋白、封闭后加入初始寡核苷酸文库、洗脱、酚抽取法提取、PCR扩增、胶回收以及反筛等操作经不同轮次筛选核酸适配体.在每轮筛选循环中,以回收产物为模板进行常规PCR扩增后再进行一轮非对称PCR扩增,获得目的条带大小为84 bp的单链核苷酸分子,用于下一轮筛选.共进行了11轮筛选,从第5轮开始反筛.将最后一轮筛选得到的对称PCR产物连接T载体后转化到DH5α感受态细胞中,经菌液PCR鉴定和测序后,利用间接酶联核酸适配体法(i-ELAA)选择测序结果出现频次较高的适配体,测定其与G蛋白的结合力,并利用软件预测其二级结构.结果显示,本实验表达了 BRSV重组G蛋白,经微孔板法筛选出了 98条适配体序列,其中G-6、G-13、G-39、G-55和G-72适配体出现频率最高;二级结构预测显示,5条核酸适配体均具有稳定的茎环状或发卡状结构,能与G蛋白特异、稳定的结合.本研究筛选出的5条核酸适配体为BRSV酶联核酸适配体法的建立奠定了基础.
文献关键词:
牛呼吸道合胞体病毒;G蛋白;微孔板法;核酸适配体
中图分类号:
作者姓名:
甄思慧;程如楠;宋想胜;李磊;张永红;王真
作者机构:
北京农学院动物科学技术学院/兽医学(中兽医)北京市重点实验室,北京 102206
文献出处:
引用格式:
[1]甄思慧;程如楠;宋想胜;李磊;张永红;王真-.牛呼吸道合胞体病毒G蛋白特异性核酸适配体的筛选及初步应用)[J].中国预防兽医学报,2022(05):490-496
A类:
ELAA
B类:
牛呼吸道合胞体病毒,核酸适配体,初步应用,BRSV,原核,利用软件,软件设计,引物,寡核苷酸,文库,利用微,微孔板法,包被,洗脱,取法,轮次,环中,条带,带大,bp,单链,选得,DH5,感受态,菌液,体法,结合力,软件预测,二级结构,结构预测,发卡
AB值:
0.240759
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