典型文献
毛果杨ZHD家族全基因组水平鉴定及在干旱胁迫下的表达分析
文献摘要：
[目的]对毛果杨Populus trichocarpa ZHD(PtrZHD)家族进行生物信息学以及干旱胁迫下表达特性分析,为研究PtrZHD在干旱胁迫中的功能提供参考.[方法]利用生物信息学方法从全基因组水平鉴定出毛果杨ZHD家族全部成员,并对其进化、理化性质、基因结构、保守基序、启动子顺式作用元件和表达特性进行分析.[结果]毛果杨ZHD家族包括21个成员,可分为7个亚家族;有8对同源基因,且非同义替换率(Ka)/同义替换率(Ks)值远小于1.该家族成员理化性质存在差异,但其结构较为保守,均含有Motif 1;启动子区含有数量不等的激素和非生物胁迫响应元件,不同基因之间响应元件的种类存在差异.在毛果杨PtrZHDs中,分别有1、7和13个基因在根、茎和叶组织中具有偏好性表达特征;PtrZHD家族成员对干旱胁迫的响应具有组织和时间表达特异性,在根、茎和叶部组织中各成员的表达量不同,但随着干旱胁迫时间的增加均呈先上升后下降的趋势.[结论]PtrZHD家族基因对干旱胁迫有不同程度的响应,可调控毛果杨对干旱胁迫的应答.
文献关键词：
毛果杨;ZHD家族基因;生物信息学分析;组织表达;干旱胁迫
中图分类号：
作者姓名：
陈雪冰;刘聪;程赫;姜廷波;夏德安;魏志刚
作者机构：
东北林业大学 林木遗传育种国家重点实验室,黑龙江 哈尔滨 150000;中国林业科学研究院 国家林业和草原局盐碱地研究中心,北京 100091
文献出处：
引用格式：
[1]陈雪冰;刘聪;程赫;姜廷波;夏德安;魏志刚-.毛果杨ZHD家族全基因组水平鉴定及在干旱胁迫下的表达分析)[J].浙江农林大学学报,2022(03):465-474
A类：
PtrZHD,PtrZHDs
B类：
毛果杨,全基因组,表达分析,Populus,trichocarpa,表达特性,利用生物,生物信息学方法,基因结构,保守基序,顺式作用元件,亚家族,同源基因,非同,同义,替换率,Ka,Ks,Motif,启动子区,非生物胁迫,胁迫响应,响应元,类存在,偏好性,表达特征,有组织,时间表达,干旱胁迫时间,先上,家族基因,可调控,生物信息学分析,组织表达
AB值：
0.241644
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