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泡桐WPR基因家族鉴定及其对丛枝植原体的响应
文献摘要：
为研究WPR基因家族在泡桐丛枝病叶片黄化中的作用,在泡桐全基因组水平上,采用生物信息学方法对WPR基因家族成员进行鉴定、进化分析、染色体定位、共线性、基因结构、蛋白性质、顺式作用元件和表达量的研究.结果表明,白花泡桐基因组中共存在16个WPR基因,分布在9条染色体上,其中,12个基因具有种内共线性,9个基因与拟南芥具有共线性;所有WPR家族成员均含光响应、防御响应及激素响应元件.通过对植原体侵染后的转录组和互作蛋白分析,发现PfWEB3、PfWPRb2、PfWPRb3和PfPMI2可能与丛枝植原体侵染后泡桐叶片黄化有关.
文献关键词：
白花泡桐;WPR基因;家族进化;植原体;全基因组;染色体定位;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
常梦悦;曹喜兵;赵振利;范国强
作者机构：
河南农业大学泡桐研究所, 河南 郑州450002
文献出处：
引用格式：
[1]常梦悦;曹喜兵;赵振利;范国强-.泡桐WPR基因家族鉴定及其对丛枝植原体的响应)[J].森林与环境学报,2022(03):312-319
A类：
WPR,泡桐丛枝病,PfWEB3,PfWPRb2,PfWPRb3,PfPMI2
B类：
基因家族鉴定,丛枝植原体,叶片黄化,全基因组,生物信息学方法,进化分析,染色体定位,共线性,基因结构,蛋白性质,顺式作用元件,白花泡桐,有种,种内,拟南芥,光响应,防御响应,激素响应,响应元,对植,侵染,转录组,互作蛋白,蛋白分析,桐叶,家族进化
AB值：
0.26057
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