典型文献
弥漫大B细胞淋巴瘤预后相关差异表达自噬基因筛选及模型的建立
文献摘要:
目的:筛选弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)自噬相关基因(ARG)的差异表达,探讨差异表达自噬基因(DEARG)在DLBCL发生发展中的作用机制并建立预后模型.方法:利用包含481例DLBCL患者临床信息及基因表达谱数据的NCICCR数据库与包含232个ARG的HADb数据库,通过R语言确定DLBCL中ARG的差异表达,GO和KEGG分析ARG与DLBCL发生发展的关系,Cox回归算法建立多基因预后模型,Kaplan-Meier方法绘制生存曲线,ROC曲线评价预后模型的可靠性.结果:从481例DLBCL患者淋巴结样本及5例正常淋巴结样本中共提取DEARG 122个,其中上调基因4个,下调基因118个.GO富集主要集中在线粒体自噬、自噬调节、细胞对外部刺激的反应等本体学注释.KEGG富集主要集中在细胞衰老、NOD样受体信号通路、PI3K-Akt信号通路、PD-1/PD-L1信号通路等.对230个临床信息完整的样本进行生存分析,单因素Cox分析发现20个ARG与DLBCL患者整体生存明显相关,多因素 Cox 回归筛选出 9 个预后相关 ARG(HIF1A、CAPNI、ITPR1、PRKCQ、TRAIL、HDAC1、TSC2、NRG3 和 MAPK3)建立DLBCL ARG预后模型.Kaplan-Meier生存曲线分析显示,高、低风险组患者的生存率比较具有显著差异(P<0.001).多因素Cox回归分析结果表明,国际预后指数和风险值是DLBCL患者的独立预后指标(P<0.05),ROC曲线下面积分别为0.762和0.747.结论:DLBCL ARG预后模型可用于预测患者的预后,但仍需大样本的临床研究加以证实.
文献关键词:
弥漫大B细胞淋巴瘤;自噬相关基因;预后
中图分类号:
作者姓名:
张钧栋;张皓旻;卢迪;王紫宁;陈浩然;卢学春
作者机构:
解放军医学院;解放军总医院第二医学中心血液病科,国家老年疾病临床医学研究中心,北京100853;山西医科大学管理学院,山西太原030604
文献出处:
引用格式:
[1]张钧栋;张皓旻;卢迪;王紫宁;陈浩然;卢学春-.弥漫大B细胞淋巴瘤预后相关差异表达自噬基因筛选及模型的建立)[J].中国实验血液学杂志,2022(04):1101-1108
A类:
DEARG,NCICCR,CAPNI,PRKCQ,NRG3
B类:
弥漫,细胞淋巴瘤,差异表达,自噬基因,基因筛选,DLBCL,自噬相关基因,预后模型,临床信息,基因表达谱,谱数据,HADb,Cox,回归算法,多基因,Kaplan,Meier,淋巴结,共提取,线粒体自噬,对外部,细胞衰老,NOD,样受体,PI3K,Akt,L1,生存分析,HIF1A,ITPR1,TRAIL,HDAC1,TSC2,MAPK3,生存曲线分析,低风险组,国际预后指数,风险值,预后指标,大样本
AB值:
0.270634
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