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典型文献
基于基因表达谱数据分析弥漫大B细胞淋巴瘤肿瘤相关巨噬细胞浸润情况及其与患者预后的相关性
文献摘要:
目的:基于弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)基因芯片表达数据库,分析肿瘤相关巨噬细胞及亚型浸润情况,探讨其与患者预后的相关性。方法:数据来源于PubMed基因表达数据库(GEO)中的DLBCL患者微阵列(Affymetrix U133 plus 2.0)数据库(编号GSE10846)。该数据库共包含414例患者,其中306例有完整的临床、细胞起源分型(COO分型)及治疗随访信息。通过基于评估RNA转录本相对占比进行细胞类型识别(CIBERSORT)的在线计算机程序进行数据分析;从生成的分析结果文件中识别出GSE10846数据库中所有患者包含各亚型巨噬细胞在内的免疫细胞在微环境中所有可识别免疫细胞中的比例。以巨噬细胞亚群占微环境所有免疫细胞比例中位值为临界值:≥临界值为高浸润。基于GSE10846数据库中所有414例DLBCL患者的myc、bcl-2、程序性死亡受体配体1(PD-L1)及程序性死亡受体配体2(PD-L2)基因表达量的中位值为临界值,≥临界值者为高表达。分析各型及总体巨噬细胞水平与临床因素、一些基因表达及生存的相关性,采用Cox比例风险模型对DLBCL患者预后进行多因素分析。采用R 4.0.4中surv_miner包中的surv_cutpoint函数确定各项巨噬细胞亚群占微环境所有免疫细胞比例的最佳临界值,<最佳临界值为统计学低浸润,≥最佳临界值为统计学高浸润。结果:经CIBERSORT分析,414例DLBCL患者中识别出肿瘤微环境中M0型巨噬细胞[15.00%(0~44.41%)]、M1型巨噬细胞[7.46%(0~23.00%)]、M2型巨噬细胞[6.28%(0~43.35%)]。具有完整的临床和随访资料的306例患者中,M0、M1、M2型和总巨噬细胞高浸润患者分别有155例(50.7%)、152例(49.7%)、156例(51.0%)、152例(49.7%),M0型巨噬细胞高浸润与COO分型为生发中心B细胞(GCB)型、PD-L1基因高表达及无myc、bcl-2 RNA水平双高表达(R-DEL)有关(均 P<0.05),M1型巨噬细胞高浸润与女性、PD-L1基因高表达、PD-L2基因高表达有关(均 P<0.05),M2型巨噬细胞高浸润与COO分型为GCB型、PD-L2基因高表达有关(均 P<0.05),总巨噬细胞高浸润与女性、COO分型为GCB型、PD-L1基因高表达、PD-L2基因高表达、无R-DEL有关(均 P<0.05)。PD-L1基因高表达与M0、M1型及总巨噬细胞高浸润相关(均 P<0.01),PD-L2基因高表达与M1、M2型巨噬细胞及总巨噬细胞高浸润相关(均 P<0.01)。M0型巨噬细胞高浸润组总生存(OS)较低浸润组好( P=0.002);M2型巨噬细胞低浸润组OS较高浸润组好( P=0.019)。R-DEL组OS较无R-DEL组差( P=0.001)。国际预后指数(IPI)评分低(0~2分)、COO分型为GCB型、治疗中采用利妥昔单抗的患者OS更好(均 P<0.01)。多因素Cox回归分析结果显示,年龄≥60岁、COO分型为非GCB分型、治疗方案中不含利妥昔单抗、M0型巨噬细胞低浸润、M2型巨噬细胞高浸润为DLBCL患者OS的独立不良影响因素(均 P<0.05)。M0型巨噬细胞最佳临界值为4.3%,M2型巨噬细胞最佳临界值为4.8%;M0型巨噬细胞统计学低浸润组OS更差( P<0.001),M2型巨噬细胞统计学高浸润组OS更差( P=0.001)。 结论:DLBCL肿瘤微环境的免疫细胞中肿瘤相关巨噬细胞含量最高。M2型巨噬细胞高浸润患者预后较差,而M0型巨噬细胞高浸润患者预后较好。
文献关键词:
淋巴瘤,大B-细胞,弥漫性;巨噬细胞;基因表达谱;诊断,计算机辅助;预后
作者姓名:
周众;时云飞
作者机构:
新疆医科大学附属中医医院病理科,乌鲁木齐 830002;北京大学肿瘤医院暨北京市肿瘤防治研究所病理科 恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室,北京 100142
文献出处:
引用格式:
[1]周众;时云飞-.基于基因表达谱数据分析弥漫大B细胞淋巴瘤肿瘤相关巨噬细胞浸润情况及其与患者预后的相关性)[J].白血病·淋巴瘤,2022(03):143-150
A类:
U133
B类:
基因表达谱,谱数据,细胞淋巴瘤,肿瘤相关巨噬细胞,巨噬细胞浸润,DLBCL,基因芯片,数据来源,基因表达数据库,GEO,微阵列,Affymetrix,plus,编号,GSE10846,COO,转录本,细胞类型,类型识别,CIBERSORT,在线计算,计算机程序,结果文件,免疫细胞,巨噬细胞亚群,中位值,myc,bcl,程序性死亡受体,死亡受体配体,L1,L2,基因表达量,各型,临床因素,Cox,比例风险模型,多因素分析,surv,miner,cutpoint,最佳临界值,肿瘤微环境,M0,M1,M2,生发中心,GCB,双高,DEL,总生存,OS,国际预后指数,IPI,利妥昔单抗,弥漫性,计算机辅助
AB值:
0.216183
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