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番鸭细小病毒NS和VP基因的克隆及序列分析
文献摘要：
为进一步了解番鸭细小病毒(MDPV)基因的遗传变异特征,本试验采用分段PCR扩增法获得了2个MDPV安徽分离株(AH1901和AH1902)基因组NS和VP全长基因,并与GenBank数据库中的20个水禽细小病毒基因组序列进行了比对.序列分析显示,克隆的MDPV基因均包括完整的NS和VP基因,分别为1 884 bp和2 199 bp,VP基因核苷酸序列变异程度相对较高,而NS基因则较为保守;进化分析显示,安徽分离株AH1901和AH1902位于同一分支,二者与国内分离的MDPV毒株ZJ-JH-2013基因遗传距离最近,可能来源于同一毒株,与MDPV疫苗株P1及国外分离毒株FM基因遗传距离则较远;安徽分离株AH1901和AH1902的NS基因序列同源性为99.8％,VP基因序列一致.两者的NS、VP基因序列与分离株ZJ-JH-2013的同源性最高,与重组型毒株SAAS-SHNH及安徽分离株AH 1401同源性也在99.5％以上;与疫苗株P1、国外分离株FM同源性则较低,其中VP基因仅为88.9％、89.3％.本试验结果表明近年国内的MDPV分离株同源性均较高,但仍存在一定程度的基因变异,增加了诊断与防控该病的难度.
文献关键词：
番鸭细小病毒;NS基因;VP基因;序列分析
中图分类号：
作者姓名：
戴银;胡晓苗;赵瑞宏;张丹俊;潘孝成;沈学怀;尹磊;周学利;侯宏艳
作者机构：
安徽省农业科学院畜牧兽医研究所,安徽合肥230031
文献出处：
引用格式：
[1]戴银;胡晓苗;赵瑞宏;张丹俊;潘孝成;沈学怀;尹磊;周学利;侯宏艳-.番鸭细小病毒NS和VP基因的克隆及序列分析)[J].中国兽医杂志,2022(01):37-42
A类：
AH1901,AH1902,SHNH
B类：
番鸭细小病毒,NS,VP,序列分析,MDPV,遗传变异,变异特征,分离株,全长,GenBank,水禽细小病毒,病毒基因组,基因组序列,bp,序列变异,进化分析,毒株,ZJ,JH,基因遗传,遗传距离,能来,疫苗株,P1,外分,FM,较远,基因序列,序列同源性,SAAS,基因变异,诊断与防控
AB值：
0.236604
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