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典型文献
中国与美国RFLP 1-4-4 lineage1C变异株同一分支PRRSV的全基因组序列分析
文献摘要:
2020年美国报道了高致病性的RFLP 1-4-4 lineage 1C PRRSV变异株,其对猪的致死率达到17.5%.为了分析美国1-4-4 lineage1C PRRSV变异株与中国当前流行的PRRSV的关系,本研究对中国不同基因亚型的PRRSV与美国新发1-4-4 lineage1C PRRSV变异株进行遗传演化分析,结果显示,中国类NADC34 PRRSV与美国RFLP 1-4-4 lineage1C PRRSV变异株关系密切;其Nsp2推导氨基酸序列比对结果显示,中国类NADC34 PRRSV与美国RFLP1-4-4 lineage1C PRRSV变异株在Nsp2区域存在相同的分子特征,即100个氨基酸(aa328~aa427)的连续缺失.PRRSV基因重组分析结果显示,美国RFLP 1-4-4 lineage1C PRRSV变异株是以类NADC34IA14737-2016株为母本毒株,并由IA/2014/NADC34和NADC30病毒株提供重组基因片段的重组病毒,而中国早期的类NADC34 PRRSV是以IA/2014/NADC34株为母本毒株的重组病毒.美国早期的类NADC34 PRRSV对仔猪的致病力差异较大,而中国早期的类NADC34PRRSV对仔猪多为中、低致病力.此外,中国HLJZD22-1812株与美国RFLP 1-4-4 lineage1C PRRSV变异株具有类似的重组模式、相同的Nsp2缺失特征、相同的1-4-4 ORF5限制性片段长度多态性(RFLP)模式,且均属于lineage 1C分支.本研究结果首次表明美国RFLP 1-4-4 lineage1C PRRSV变异株与中国类NADC34(PRRSV)属于同一亚型分支,且具有一致的分子特征,提示类NADC34 PRRSV在我国的流行及演化情况需高度关注.
文献关键词:
1-4-4 PRRSV变异株;类NADC34 PRRSV;100个氨基酸缺失;重组病毒
作者姓名:
许浒;李超;相丽润;汤艳东;赵静;龚帮俊;李宛生;付军;彭金美;王倩;周国辉;冷超粮;安同庆;蔡雪辉;张洪亮;田志军
作者机构:
中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室,黑龙江 哈尔滨 150069;南阳师范学院,河南 南阳 473061
引用格式:
[1]许浒;李超;相丽润;汤艳东;赵静;龚帮俊;李宛生;付军;彭金美;王倩;周国辉;冷超粮;安同庆;蔡雪辉;张洪亮;田志军-.中国与美国RFLP 1-4-4 lineage1C变异株同一分支PRRSV的全基因组序列分析)[J].中国预防兽医学报,2022(02):202-207
A类:
lineage1C,RFLP1,aa328,aa427,NADC34IA14737,NADC34PRRSV,HLJZD22
B类:
变异株,全基因组序列分析,高致病性,致死率,基因亚型,遗传演化分析,Nsp2,氨基酸序列比对,分子特征,基因重组,重组分析,母本,毒株,NADC30,重组病毒,中国早期,仔猪,致病力,重组模式,ORF5,限制性片段长度多态性,演化情况
AB值:
0.152059
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