典型文献
高温胁迫诱导薄荷差异表达基因的分析
文献摘要：
目的:分析薄荷幼苗高温胁迫下的差异基因表达情况,从中挖掘薄荷幼苗的耐热功能基因,为薄荷幼苗的抗逆机制提供生物信息学依据.方法:以水培薄荷为研究对象,分别进行高温胁迫0 h(对照,CK)、3 h(40℃,HT-3 h)和6 h(40℃,HT-6 h)的3种处理,然后进行转录组测序,对比分析筛选出高温胁迫应答的基因,并对部分基因利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)进行验证.结果:HT-3 h vs CK和HT-6 h vs CK的共同差异表达基因(Differential expressed genes,DEGs)有1042个,其中上调基因590个,下调基因452个.对共有DEGs进行GO功能富集分析,以对p值矫正后的FDR≤0.05为阈值,得出55条GO terms功能组为显著富集,主要体现在生物过程(Biological Process,BP)方面,包括活性氧反应、对刺激的反应、热反应等;KEGG功能富集分析得出,共有611个DEGs映射到171条通路当中,主要涉及代谢途径、内质网中的蛋白质加工、核糖体、次级代谢产物的生物合成等方面.进一步挖掘响应HT-3 h和HT-6 h的共有DEGs中,上调的有33个Hsp家族的基因,主要包括19个Hsp20基因,5个Hsp90基因和7个HSPAls基因等;另有5个转录因子BES1、GRAS、HB-HD-ZIP、MYB-related、NAC亦显示上调.利用qRT-PCR对测序数据进行验证,基因的表达趋势与转录组测序结果一致,证明测序结果真实可靠.结论:薄荷通过启动活性氧代谢或氧化应激等生物进程来响应高温胁迫,并通过内质网中的蛋白质加工等途径来抵御高温伤害.上调热激蛋白Hsp20、Hsp90、HSPAls等基因和BES1、GRAS、HB-HD-ZIP、MYB-related、NAC等5个转录因子家族的相关基因,对薄荷的耐热调控具有积极意义.
文献关键词：
薄荷;高温胁迫;转录组分析;热激蛋白;转录因子
中图分类号：
作者姓名：
朱丹;秦亚东;李林华;高焕
作者机构：
安徽中医药高等专科学校,安徽 芜湖 241000;安徽师范大学,安徽 芜湖 241000
文献出处：
引用格式：
[1]朱丹;秦亚东;李林华;高焕-.高温胁迫诱导薄荷差异表达基因的分析)[J].安徽科技学院学报,2022(06):54-62
A类：
HSPAls
B类：
高温胁迫,薄荷,差异表达基因,幼苗,苗高,差异基因表达,耐热,功能基因,抗逆,水培,HT,转录组测序,胁迫应答,qRT,Differential,expressed,genes,DEGs,功能富集分析,FDR,terms,功能组,生物过程,Biological,Process,热反应,射到,代谢途径,内质网,蛋白质加工,核糖体,次级代谢产物,生物合成,Hsp20,Hsp90,BES1,GRAS,HB,HD,ZIP,MYB,related,NAC,序数,果真,启动活性,活性氧代谢,热激蛋白,转录组分析
AB值：
0.305588
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
