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水稻基因组任意区间InDel标记开发方法
文献摘要：
基于极端表型单株高通量测序的定位方法QTL-seq已成为植物QTL分析的一种主要方法.继QTL-seq分析后,对目标QTL定位区间进行分子标记开发时,由于目标区间大,所含变异位点多,特定区间的分子标记开发仍是一件较繁琐的事.为提高特定区间分子标记开发的效率,本研究建立了基于高通量测序数据基础的特定脚本程序,可简单快速地完成水稻基因组任意区间的InDel标记开发.本研究开发了来自7个不同作图群体和染色体区间的有8 bp以上片段长度差异的InDel标记708个,平均每17.6 kb有1个InDel标记;对95个标记进行试验验证,总体多态频率为63％.本研究建立的方法在水稻及其他已测序的植物重要农艺性状控制QTL的分子标记辅助育种、精细定位和图位克隆中有重要应用价值.
文献关键词：
水稻;分子标记开发;高通量测序;QTL定位(QTL-seq);InDel标记;多态频率
中图分类号：
作者姓名：
孙玥;杨秀荣;郭彦丽;李军玲;李月娇;孙淑琴;路信;刘燕清;佟卉;孙林静;刘静妍;张融雪;王晓静;苏京平;王胜军;赵习朴;闫双勇
作者机构：
天津市农业科学院农作物研究所/天津市农作物遗传育种重点实验室,天津300384;天津市农业科学院植物保护研究所,天津300384
文献出处：
引用格式：
[1]孙玥;杨秀荣;郭彦丽;李军玲;李月娇;孙淑琴;路信;刘燕清;佟卉;孙林静;刘静妍;张融雪;王晓静;苏京平;王胜军;赵习朴;闫双勇-.水稻基因组任意区间InDel标记开发方法)[J].江苏农业科学,2022(01):34-39
A类：
多态频率
B类：
水稻,InDel,开发方法,单株,株高,定位方法,QTL,seq,主要方法,分子标记开发,目标区,所含,变异位点,较繁,序数,数据基础,脚本,研究开发,作图,bp,上片,段长度,长度差,kb,农艺性状,分子标记辅助育种,精细定位,图位克隆,隆中,重要应用
AB值：
0.296427
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