典型文献
侵染小构树的双生病毒及其缺陷DNA形式的检测和特征分析
文献摘要:
为明确侵染小构树(Broussonetia kazinoki)并引起叶片黄化卷曲症状的病毒种类及其基因组特征,本研究利用转录组高通量测序技术获得病毒基因组,利用PCR扩增和基因克隆技术对病毒基因组及其缺陷DNA进行鉴定.结果表明,通过转录组高通量测序和无参组装,获得引起小构树叶片黄化卷曲的双生病毒,命名为小构树卷叶病毒2(Kozo leaf curl virus 2,KozoLCV-2).进一步克隆测序获得的KozoLCV-2基因组全长为3756~3758 bp,其与构树卷叶病毒(Paper mulberry leaf curl virus 2,PMLCV-2)具有相同的基因组结构和较高的序列一致性;病毒正义链编码4个ORF(V1、V2、V3和V4),互补链编码2个(C1和C1:C2),互补链存在选择性剪接.PCR扩增和克隆测序获得了10种KozoLCV-2的缺陷DNA(defective DNA,D-DNA)形式,其中9种完全或部分缺失复制酶区域,4种形式的D-DNAs与来自PMLCV-2-TL RepA第二外显子末端的序列发生了重组.
文献关键词:
小构树;转录组;小构树卷叶病毒2;分子特征;缺陷DNA
中图分类号:
作者姓名:
孔卫青;杨金宏;凌君;楚渠;孟刚
作者机构:
安康学院陕西省蚕桑重点实验室,陕西 安康 725000
文献出处:
引用格式:
[1]孔卫青;杨金宏;凌君;楚渠;孟刚-.侵染小构树的双生病毒及其缺陷DNA形式的检测和特征分析)[J].山东农业科学,2022(09):131-136
A类:
小构树,kazinoki,Kozo,KozoLCV,PMLCV,RepA
B类:
侵染,双生,生病,Broussonetia,叶片黄化,卷曲,病毒种类,基因组特征,研究利用,转录组,高通量测序技术,技术获得,得病,病毒基因组,基因克隆,克隆技术,构树叶,卷叶病,leaf,curl,virus,克隆测序,基因组全长,bp,Paper,mulberry,基因组结构,序列一致性,ORF,V1,V2,V3,V4,C1,C2,选择性剪接,defective,复制酶,DNAs,TL,二外,外显子,分子特征
AB值:
0.335349
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