典型文献
尖孢镰孢菌与番茄互作早期milRNA调控功能研究
文献摘要：
[目的]MicroRNA通过调控其靶基因在生物活动中起到重要的作用,本研究目的是为了明确尖孢镰孢菌与番茄互作早期相关milRNAs的分子功能及调控机制.[方法]采用实时荧光定量PCR法对尖孢镰孢菌番茄专化型菌株侵染寄主早期pri-milRNAs和milRNAs靶基因进行基因表达分析,利用STRING蛋白互作网络数据库和Cytoscape软件预测该菌株milRNAs与靶基因间的蛋白互作网络,并结合DAVID在线分析工具对相关基因进行生物学功能分析.[结果]实时荧光定量PCR结果表明,供试的pri-milRNA_2a和pri-milRNA_2b与FOXG_03470、pri-milRNA_3b与FOXG_04910、pri-milRNA_4与FOXG_08812、pri-milRNA_6与FOXG_00067表达趋势基本相反,4个miLRNA与相应基因可能存在靶标关系;蛋白互作网络预测结果可知,尖孢镰孢菌fox_milRNA_1、fox_milRNA_2、fox_milRNA_3和fox_milRNA_8的靶基因间互作较为紧密.其中,fox_milRNA_1的靶基因FOXG_04240与fox_milRNA_2的靶基因FOXG_03470能够同该蛋白互作网络中诸多的基因进行互作,推测为该蛋白互作网络中的枢纽基因;该蛋白互作网络主要分子功能为氧化还原酶活性,主要参与的生物学过程为小GTP酶介导的信号转导.fox_milRNA_3的靶基因FOXG_04910可通过调节Rho基因影响菌株的生长,推断其和菌株与寄主的信号识别和菌株在寄主中定植有关.[结论]本研究通过试验验证和生物信息学预测发现,尖孢镰孢菌侵染番茄初期,存在milRNAs及其下游靶基因的调控网络.上述结果为进一步深入研究尖孢镰孢菌milRNA的功能提供一个新思路.
文献关键词：
microRNA-like RNA;初级milRNA;蛋白互作网络;尖孢镰孢菌;靶基因
中图分类号：
作者姓名：
畅引东;贾仡伟;何瑞;张萌;孟广军;李新凤;张作刚;王建明
作者机构：
山西农业大学 植物保护学院 农业有害生物综合治理山西省重点实验室,山西 太原 030031;山西省植物保护植物检疫中心,山西 太原 030001
文献出处：
引用格式：
[1]畅引东;贾仡伟;何瑞;张萌;孟广军;李新凤;张作刚;王建明-.尖孢镰孢菌与番茄互作早期milRNA调控功能研究)[J].山西农业大学学报（自然科学版）,2022(06):102-112
A类：
milRNA,milRNAs,FOXG,miLRNA
B类：
尖孢镰孢菌,番茄,互作早期,调控功能,功能研究,MicroRNA,靶基因,研究目的,调控机制,侵染,寄主,pri,基因表达分析,STRING,蛋白互作网络,网络数据库,Cytoscape,软件预测,DAVID,在线分析工具,生物学功能分析,2a,2b,3b,靶标,fox,枢纽基因,氧化还原酶,生物学过程,GTP,信号转导,Rho,信号识别,定植,调控网络,microRNA,like
AB值：
0.176566
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