典型文献
葡萄VvWDR1生物信息学分析及其互作蛋白分析
文献摘要：
[目的]探究葡萄WDR1蛋白的作用机理,丰富原花青素和花青苷物质合成调控机理.[方法]采用PCR技术克隆葡萄WDR1基因CDS区,运用生物信息学分析对其编码蛋白理化性质、亲疏水性、信号肽及跨膜结构域、二级结构、三级结构、保守结构域等进行预测;将VvWDR1的CDS全长克隆至酵母双杂交诱饵载体pGBKT7中,转化酵母感受态细胞并进行毒性及自激活检测分析;通过酵母双杂系统对葡萄WDR1与MYBPA2、MYC2蛋白互作机制进行研究.[结果]WDR1基因cDNA全长1011 bp,编码366个氨基酸,分子量37.8 kD,等电点5.07,分子式为C1671H2588N458O518S11;无信号肽且不具有跨膜结构域,其编码蛋白的二级结构中无规则卷曲39.29％,β?折叠26.79％,α?螺旋22.02％,β?转角11.90％;该蛋白含有5个WD40基序.同时对葡萄WDR1蛋白进行系统进化分析,发现与PhAN11、AtTTG1的同源性较高;成功构建表达载体pGBKT7?WDR1、pGBKT7?MYC2、pGADT7?MYC2,并鉴定出VvWDR1在酵母细胞中无自激活活性且无毒性;酵母双杂交试验结果显示,共转化pGBKT7?WDR1/pGADT7?MYBPA2与pGBKT7?WDR1/pGADT7?MYC2的酵母菌可以在SD/?Trp?Leu?His?Ade的四缺培养基上正常生长.[结论]克隆得到葡萄WDR1基因,对其进行生物信息学分析,且通过酵母双杂交证明VvWDR1与VvMYBPA2、Vv?MYC2编码的蛋白之间存在相互作用.
文献关键词：
葡萄;VvWDR1;VvMYBPA2;VvMYC2;酵母双杂交
中图分类号：
作者姓名：
郭建勇;杨波;梁长梅;张鹏飞;温鹏飞
作者机构：
山西农业大学 园艺学院,山西 太谷 030801;山西农业大学 信息科学与工程学院,山西 太谷 030801
文献出处：
引用格式：
[1]郭建勇;杨波;梁长梅;张鹏飞;温鹏飞-.葡萄VvWDR1生物信息学分析及其互作蛋白分析)[J].山西农业大学学报（自然科学版）,2022(01):43-50
A类：
VvWDR1,WDR1,MYBPA2,C1671H2588N458O518S11,PhAN11,AtTTG1,VvMYBPA2,Vv,VvMYC2
B类：
生物信息学分析,互作蛋白,蛋白分析,原花青素,花青苷,合成调控,调控机理,CDS,编码蛋白,亲疏水性,信号肽,跨膜结构域,二级结构,三级结构,保守结构域,全长,酵母双杂交,诱饵载体,pGBKT7,感受态,自激活检测,检测分析,蛋白互作,互作机制,cDNA,bp,分子量,kD,等电点,分子式,无规则,卷曲,折叠,WD40,基序,系统进化分析,同源性,建表,表达载体,pGADT7,酵母细胞,活活,无毒性,杂交试验,共转化,酵母菌,Trp,Leu,His,Ade,白之
AB值：
0.282113
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