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典型文献
北五味子在胸主动脉瘤发生发展中作用机制的网络药理学和分子对接技术分析
文献摘要:
目的:探讨北五味子(SCF)在胸主动脉瘤(TAA)发生发展过程中的作用,并阐明其可能的机制.方法:整合中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、Uniprot、Swiss TargetPrediction、CTD、GeneCards、OpenTargets和OMIM多个数据库获取SCF作用于TAA的潜在靶点;利用String数据库和Cytoscape软件构建靶点蛋白-蛋白互作(PPI)网络,并进行拓扑网络分析得到SCF作用于TAA的核心靶点;借助Omicshare在线分析平台对潜在作用靶点进行潜在靶点的基因本体(GO)和京都基因组与基因百科全书(KEGG)富集分析;通过GEO数据库提取SCF有效成分—五味子酯乙(SchB)刺激大鼠主动脉平滑肌细胞基因表达谱,验证核心靶点表达水平;应用Autodock软件将核心靶点进行分子对接验证.结果:获得SCF影响TAA的潜在靶点46个,GO富集分析主要涉及细胞增殖、催化活性和蛋白质代谢等生物学过程,KEGG富集分析主要涉及血管内皮生长因子(VEGF)、受体酪氨酸蛋白激酶(ErbB)和缺氧诱导因子1(HIF-1)3条信号通路,拓扑网络分析得到信号转导与转录激活因子3(STAT3)和基质金属蛋白酶9(MMP9)等10个核心靶点.基因表达谱分析,与转化生长因子β1(TGF-β1)组比较,SchB-TGF-β1组核心靶基因STAT3和MMP9表达水平明显下调(P<0.05).结论:SCF的主要活性成分SchB等可能通过靶向STAT3等信号通路,抑制血管平滑肌中MMP9表达水平,进而减轻主动脉中细胞外基质降解,发挥抑制TAA发生发展的作用.
文献关键词:
网络药理学;北五味子;胸主动脉瘤;分子对接
作者姓名:
李妍;侯月;牟星蔚;刘冰清;万红;刘畅;夏薇
作者机构:
北华大学医学技术学院实验中心,吉林 吉林 132000
引用格式:
[1]李妍;侯月;牟星蔚;刘冰清;万红;刘畅;夏薇-.北五味子在胸主动脉瘤发生发展中作用机制的网络药理学和分子对接技术分析)[J].吉林大学学报(医学版),2022(02):414-425
A类:
OpenTargets
B类:
北五味子,胸主动脉瘤,网络药理学,分子对接技术,SCF,TAA,系统药理学,分析平台,TCMSP,Uniprot,Swiss,TargetPrediction,CTD,GeneCards,OMIM,潜在靶点,String,Cytoscape,软件构建,靶点蛋白,蛋白互作,PPI,拓扑网络,核心靶点,Omicshare,在线分析,潜在作用,作用靶点,基因本体,京都,百科全书,富集分析,GEO,有效成分,SchB,主动脉平滑肌细胞,基因表达谱,Autodock,催化活性,蛋白质代谢,生物学过程,血管内皮生长因子,VEGF,酪氨酸蛋白激酶,ErbB,缺氧诱导因子,HIF,信号转导,转录激活因子,STAT3,基质金属蛋白酶,MMP9,表达谱分析,转化生长因子,TGF,靶基因,主要活性成分,血管平滑肌,细胞外基质
AB值:
0.300805
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