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典型文献
基于网络药理学和分子对接探究二氢杨梅素调脂抗肝癌的作用
文献摘要:
目的 应用网络药理学和分子对接方法 探究二氢杨梅素调脂抗肝癌的作用.方法 SwissTarget、Tar-getNet、TCMSP数据库预测二氢杨梅素的潜在靶点,GeneCards、OMIM、TTD数据库获得肝癌和脂质代谢的相关基因.采用Venny 2.1.0得到二氢杨梅素调脂抗肝癌的相关靶点,STRING数据库、Cytoscape软件对相关靶点相互作用网络进行可视化分析.采用Rstudio软件对相关靶点进行GO和KEGG富集分析,利用PyMol 2.5.1和Autodock Vina软件对核心靶点基因进行分子对接验证.结果 共获得二氢杨梅素作用靶点179个,脂质代谢相关基因427个及肝癌相关基因1246个.二氢杨梅素调脂抗肝癌的潜在靶点15个,核心靶点基因9个,主要涉及卵巢类固醇生成、类固醇激素生物合成、化学致癌物-受体激活等通路.核心靶点基因与二氢杨梅素具有较好结合性.结论 二氢杨梅素可能通过作用于9个核心靶点影响生物学过程,调节关键通路从而发挥其调脂抗肝癌作用.
文献关键词:
二氢杨梅素;脂质代谢;肝癌;网络药理学;分子对接
作者姓名:
谷佳;贺卫和;刘乐平;刘超;王文茂;王炜;覃丽
作者机构:
湖南中医药大学药学院干细胞中药调控与应用实验室,湖南省长沙市410208;湖南中医药大学药学院中药民族药物创新发展国际实验室,湖南省长沙市410208;张家界莓茶工程技术研究中心 湖南乾坤生物科技有限公司,湖南省张家界市427000
引用格式:
[1]谷佳;贺卫和;刘乐平;刘超;王文茂;王炜;覃丽-.基于网络药理学和分子对接探究二氢杨梅素调脂抗肝癌的作用)[J].中南医学科学杂志,2022(06):791-795
A类:
getNet
B类:
网络药理学,分子对接,二氢杨梅素,调脂,抗肝癌,对接方法,SwissTarget,TCMSP,潜在靶点,GeneCards,OMIM,TTD,Venny,STRING,Cytoscape,相互作用网络,Rstudio,富集分析,PyMol,Autodock,Vina,核心靶点,靶点基因,共获,作用靶点,脂质代谢相关基因,类固醇激素,生物合成,化学致癌物,结合性,生物学过程
AB值:
0.253616
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