典型文献
外周血基因表达谱探测新型冠状病毒肺炎潜在诊断标志物
文献摘要：
使用基因表达数据库(gene expression ominibus,GEO)芯片数据GSE161731,利用差异表达分析、Lasso回归等方法,筛选区分早期COVID-19患者的关键基因,应用ROC曲线评价关键基因的早期COVID-19患者诊断准确性.基于权重基因共表达网络分析(WGCNA)构建的共表达网络,筛选出不同疾病组对应的关键基因.KEGG富集分析用于阐释基因模块的功能和相关信号通路.共获得509个差异基因,并初步筛选出17种早期COVID-19患者潜在诊断标志物,包括YBL2、PKMYT1、HJURP、TCN2、TTC24、ESPL1、GZMK、RPA3、ATP5F1E、CD2、ZAP70、IL15RA、NFYB、CIAO2A、PLRG1、GPATCH11和MRPL33.KEGG结果显示差异基因主要与细胞周期、T细胞免疫、氧化磷酸化有关.WGCNA分析确定的COVID-19特异性基因模块,主要参与核糖体蛋白的合成、氧化磷酸化等生理活动.
文献关键词：
COVID-19;外周血;生物信息学分析;转录组
中图分类号：
作者姓名：
张思嘉;张顺;蔡挺
作者机构：
中国科学院大学 宁波生命与健康产业研究院,宁波 315100
文献出处：
引用格式：
[1]张思嘉;张顺;蔡挺-.外周血基因表达谱探测新型冠状病毒肺炎潜在诊断标志物)[J].生物学杂志,2022(05):13-20
A类：
ominibus,GSE161731,YBL2,PKMYT1,TTC24,GZMK,RPA3,ATP5F1E,IL15RA,CIAO2A,PLRG1,GPATCH11,MRPL33
B类：
基因表达谱,诊断标志物,基因表达数据库,gene,expression,GEO,差异表达分析,Lasso,选区,关键基因,诊断准确性,权重基因共表达网络分析,WGCNA,富集分析,共获,差异基因,初步筛选,HJURP,TCN2,ESPL1,CD2,ZAP70,NFYB,细胞周期,细胞免疫,氧化磷酸化,特异性基因,核糖体蛋白,生物信息学分析,转录组
AB值：
0.270315
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