典型文献
甘薯WRKY转录因子编码基因IbWRKY53L的生物信息学及表达特性分析
文献摘要：
WRKY作为植物中最大的转录因子家族之一,广泛参与了植物对多种环境逆境的响应过程.以甘薯徐薯22为研究材料,通过转录组分析筛选出受盐胁迫诱导的IbWRKY53L基因.序列分析发现,IbWRKY53L基因编码363个氨基酸残基,该蛋白具有1个WRKYGQK保守结构域和1个C2 H2型锌指结构,结合进化树分析表明,其属于Ⅱ d亚组WRKY转录因子成员.生物信息学分析显示,IbWRKY53L蛋白位于细胞核,为不稳定亲水性蛋白,不存在信号肽以及跨膜结构域,含有多个潜在的磷酸化位点.qRT-PCR分析表明,IbWRKY53L基因的表达受NaCl、冷及热胁迫的诱导,且对ABA、JA和SA激素也有不同程度的应答.这些结果将为深入探究IbWRKY53L基因在甘薯非生物胁迫应答中的潜在功能奠定基础.
文献关键词：
甘薯;基因表达;生物信息学分析;WRKY转录因子
中图分类号：
作者姓名：
郭芬;孟小庆;刘思媛;张成彬;李宗芸;朱明库
作者机构：
江苏师范大学生命科学学院,江苏徐州221116
文献出处：
引用格式：
[1]郭芬;孟小庆;刘思媛;张成彬;李宗芸;朱明库-.甘薯WRKY转录因子编码基因IbWRKY53L的生物信息学及表达特性分析)[J].江苏师范大学学报（自然科学版）,2022(04):22-27
A类：
IbWRKY53L
B类：
甘薯,因子编码,编码基因,表达特性,逆境,响应过程,转录组分析,盐胁迫,序列分析,基因编码,氨基酸残基,WRKYGQK,保守结构域,C2,H2,锌指,进化树分析,生物信息学分析,细胞核,定亲,亲水性,信号肽,跨膜结构域,磷酸化,qRT,NaCl,热胁迫,ABA,JA,SA,非生物胁迫,胁迫应答
AB值：
0.339118
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