典型文献
玉米ZmPRR1-1基因启动子的克隆及序列分析
文献摘要：
克隆玉米伪应答调控基因ZmPRR1-1启动子并对其序列进行分析,以期为深入研究ZmPRR1-1基因的调控机制及基因功能提供参考.以玉米黄早4的叶片为供试材料,参考已公布玉米自交系CML247基因组中Zm-PRR1-1启动子的序列信息设计引物,克隆ZmPRR1-1基因的启动子,并利用生物信息学对启动子中的核心区域、顺式作用元件、转录因子结合位点和CpG岛进行预测分析.克隆得到长度约2600 bp的ZmPRR1-1启动子,预测ZmPRR1-1启动子可能存在2个核心启动子区域,除了存在核心元件TATA-box和启动子增强元件CAAT-box外,还存在光响应、激素应答、胁迫响应等顺式作用元件.转录因子结合位点分析表明,ZmPRR1-1启动子区中预测包含ERF在内的6种转录因子家族,此外在启动子区域中预测存在4个符合限定条件的CpG岛区域.玉米ZmPRR1-1启动子区域存在丰富的顺式作用元件和转录因子结合位点,暗示ZmPRR1-1可能受到外界多种类型调控因子的调控并启动转录起始,且在多种调控网络中发挥功能.
文献关键词：
玉米;PRR基因;启动子;克隆;生物信息学分析
中图分类号：
作者姓名：
仝帧翰;刘青青;张严玲;王雷立;李安然;董柯清;王闻琦;王盼盼;王翠玲
作者机构：
河南科技大学,河南 洛阳 471023
文献出处：
引用格式：
[1]仝帧翰;刘青青;张严玲;王雷立;李安然;董柯清;王闻琦;王盼盼;王翠玲-.玉米ZmPRR1-1基因启动子的克隆及序列分析)[J].作物研究,2022(04):354-362
A类：
ZmPRR1,CML247,PRR1
B类：
基因启动子,序列分析,调控基因,调控机制,基因功能,玉米自交系,序列信息,信息设计,引物,利用生物,核心区域,顺式作用元件,转录因子结合位点,CpG,预测分析,bp,核心启动子,启动子区域,TATA,box,CAAT,光响应,激素应答,胁迫响应,ERF,限定条件,暗示,多种类型,调控因子,录起,调控网络,生物信息学分析
AB值：
0.245696
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