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典型文献
3个绒山羊品种DRB1基因遗传变异和生物信息学分析
文献摘要:
[目的]探明新疆山羊、内蒙古绒山羊和西藏山羊DRB1基因第2外显子遗传变异和分子结构情况,为MHC基因在绒山羊抗病育种奠定基础.[方法]采用直接测序法检测3个绒山羊品种DRB1基因第2外显子多态性及其遗传变异情况,并利用生物信息学对编码的氨基酸序列进行分析.[结果]3个绒山羊品种的遗传多样性较高,品种总基因分化系数Gst为0.002 73,总遗传分化指数Fst为0.181 24,总基因流Nm为1.13,品种内分子变异占75.29%、品种间变异占24.71%,3个绒山羊品种DRB基因均受到明显的选择压力作用,3个绒山羊品种与野山羊亲缘关系较近.绒山羊DRB1序列第2外显子含有80个氨基酸残基,包括19种氨基酸,为不稳定亲水性蛋白,磷酸化修饰位点较多,无信号肽序列,二级结构主要为α-螺旋和无规卷曲.[结论]3个绒山羊品种DRB1基因均具有高的遗传多样性,在进化过程中受到较强的选择压力.
文献关键词:
新疆山羊;绒山羊;西藏山羊;DRB1;遗传变异;生物信息
作者姓名:
吕雪峰;许艳丽;郑文新;胡昕;王乐
作者机构:
新疆畜牧科学院畜牧业质量标准研究所,新疆乌鲁木齐830000
文献出处:
引用格式:
[1]吕雪峰;许艳丽;郑文新;胡昕;王乐-.3个绒山羊品种DRB1基因遗传变异和生物信息学分析)[J].贵州农业科学,2022(12):88-97
A类:
新疆山羊,西藏山羊,藏山羊
B类:
DRB1,基因遗传变异,生物信息学分析,内蒙古绒山羊,外显子,分子结构,MHC,抗病育种,直接测序,多态性,变异情况,利用生物,氨基酸序列,遗传多样性,Gst,遗传分化,Fst,基因流,Nm,种内,种间变异,选择压力,野山羊,亲缘关系,氨基酸残基,定亲,亲水性,磷酸化修饰,修饰位点,信号肽,肽序列,二级结构,无规,卷曲
AB值:
0.2761
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