典型文献
沃柑叶片响应柑橘溃疡病菌侵染的转录组分析
文献摘要：
[目的]了解沃柑叶片响应柑橘溃疡病侵染的分子机制及易感品种与柑橘溃疡病菌的互作应答机制,筛选出柑橘溃疡病菌危害沃柑叶片时的相关应答基因,为抗性育种提供基因基础.[方法]以接种溃疡病菌后0、2、4、6和8 d的沃柑叶片为试材,利用Novaseq 6000平台进行转录组双向测序,并对数据进行生物信息学相关性分析.[结果]接种无菌水(CK)后0、2、4、6和8d获得的Cleanreads分别是48 482 127、47 270 288、50 998 549、53 201 972和47 924 731 条,接种柑橘溃疡病菌(JZY)后 0、2、4、6 和 8 d获得的 Clean reads 分别是 51 042 967、49 552 248、46 734 029、47 940 345 和45 371 891条.接种后0、2、4、6和8 d的上调差异表达基因数量分别为1、947、1081、656和2108个,下调差异表达基因数量分别为1、343、753、303和1908个.在接种后2、4、6和8 d有374个基因均表达差异,其中上调基因为61个,下调基因为313个.GO功能富集分析结果显示,沃柑叶片响应溃疡病不同时期的差异表达基因,主要集中在生物进程、分子功能和细胞组分中.KEGG注释分析结果显示,差异表达基因主要参与次生代谢物的生物合成、植物与病原体相互作用、植物激素信号转导、过氧化物酶体和蛋白质内质网合成等途径.[结论]植物与病原体相互作用、植物激素信号转导、过氧化物酶体和蛋白质内质网合成4条通路为柑橘感抗病相关的重要代谢通路.研究结果可作为深入研究柑橘种质资源感抗溃疡病基因和探究柑橘与病原菌互作分子机制的理论提供参考依据.
文献关键词：
沃柑;柑橘溃疡病;离体接种;转录组;差异表达基因
中图分类号：
作者姓名：
邱发发;潘贞珍;李鸾翔;夏黎明;黄桂香
作者机构：
广西大学农学院,南宁530005;广西南亚热带农业科学研究所,广西崇左532400
文献出处：
引用格式：
[1]邱发发;潘贞珍;李鸾翔;夏黎明;黄桂香-.沃柑叶片响应柑橘溃疡病菌侵染的转录组分析)[J].果树学报,2022(04):631-643
A类：
Cleanreads,JZY
B类：
沃柑,柑橘溃疡病菌,侵染,转录组分析,应答机制,片时,应答基因,抗性育种,Novaseq,无菌水,8d,调差,差异表达基因,表达差异,功能富集分析,次生代谢物,生物合成,病原体,植物激素,激素信号,信号转导,过氧化物酶体,内质网,感抗,代谢通路,柑橘种质,种质资源,抗溃疡病,离体接种
AB值：
0.197885
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