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典型文献
MYB基因家族在桃不同育性品种中的表达模式分析
文献摘要:
[目的]探究MYB基因家族成员在桃雄性不育中的表达模式,以筛选出与花粉发育相关的桃MYB家族成员.[方法]选择桃可育品种红芙蓉和不育品种沙红,以其红盛花前30,24,18,15 d(依次对应S1、S2、S3、S4时期)的花芽及盛花期花蕾为材料,对花药形态进行观察与比较;对2个桃品种S1~S3时期花芽中差异表达的MYB基因家族成员进行鉴定,并根据其FPKM值绘制热图;利用MEGA6软件,对桃花芽发育过程中差异表达的MYB转录因子和拟南芥、水稻等物种的28条MYB蛋白序列进行多重比对,构建系统进化树;从桃MYB基因家族成员中选择6个(PPrupe.3G046900、Prupe.1G551400、Prupe.4G192000、Prupe.1G323400、Prupe.1G273900和 Prupe.2G192100)表达趋势可能与育性相关并且与其他物种同源性较高的成员,分析其在不同育性桃品种中的表达特性.[结果]在盛花前18 d(S3时期)时,红芙蓉与沙红花药形态出现差异,红芙蓉花药最终表现为橙红色且较为饱满,而沙红则表现为淡黄色且瘪小.39个MYB基因家族成员在沙红和红芙蓉之间差异表达,其中27个属于R2R3-MYB类转录因子;根据FPKM值聚类热图,39个MYB基因家族成员被分为3簇.由系统进化树可知,所有MYB蛋白被分成16簇,其中Prupe.3G046900与 AtMYB26、Prupe.3G017100与 AtMYB99、Prupe.3G0006300与 AtMYB108同源性较高;而Prupe.1G276300与 AtMYB25和 AtMYB1,Prupe.1G551400、Prupe.1G323400与 AtMYB4 和 AtMYB32分别单独成为 1簇.Prupe.3G046900在可育品种各时期花芽中的表达量高于不育品种,Prupe.1G551400、Prupe.1G323400、Prupe.4G192000于花粉败育发生前后在不育品种花芽中的表达量高于可育品种.[结论]推测桃MYB基因家族成员Prupe.3G046900、Prupe.1G551400、Prupe.1G323400、Prupe.4G192000参与桃花粉发育的调控.
文献关键词:
桃;MYB转录因子;花粉不育;基因表达
作者姓名:
万淑媛;李琴;赵彩平
作者机构:
西北农林科技大学园艺学院,陕西杨凌712100
引用格式:
[1]万淑媛;李琴;赵彩平-.MYB基因家族在桃不同育性品种中的表达模式分析)[J].西北农林科技大学学报(自然科学版),2022(03):97-106
A类:
PPrupe,3G046900,1G551400,4G192000,1G323400,1G273900,2G192100,AtMYB26,3G017100,AtMYB99,3G0006300,AtMYB108,1G276300,AtMYB25,AtMYB1,AtMYB4,AtMYB32
B类:
基因家族,育性,表达模式分析,雄性不育,花粉发育,S1,S2,S3,S4,盛花期,花蕾,花药,差异表达,FPKM,制热,热图,MEGA6,桃花,花芽发育,拟南芥,水稻,建系,系统进化树,同源性,表达特性,红花,芙蓉花,橙红色,饱满,淡黄色,R2R3,花粉败育,发生前后,种花,花粉不育
AB值:
0.168453
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