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典型文献
转录组测序分析甘蓝型油菜DW871矮化性状
文献摘要:
DW871是一个具有特异株型的甘蓝型油菜矮化品系.为了研究DW871的相关基因及其表达模式,我们以甘蓝型高秆油菜HW871为对照,选取抽薹期茎秆组织进行转录组基因表达分析.结果显示:DW871与HW871之间存在8665个显著差异基因,其中上调基因2582个,下调基因6083个.通过GO富集分析可注释到3个大类共22个亚类中.通过KEGG富集分析注释到5个大类31个亚类共295个通路中.我们从显著差异基因中筛选了与矮化性状密切相关的基因,在果胶降解代谢途径中注释到了43个差异基因;在生长素信号转导途径中注释到了69个差异基因;在木质素单体合成途径中注释到22个差异基因.发现DW871的矮化性状与细胞伸长、细胞壁形成和细胞分裂的异常以及生长素信号传导的受阻有关.尤其在木质素单体合成途径中的,可能通过调控PAL和CCR等酶的表达,改变木质素的合成速率和组成,进而对一系列与木质素相关的生理生化过程进行调控.因此提出DW871的矮化机制,即生长素应答和木质素合成的异常,造成了细胞伸长、生长和细胞壁变化的异常,并最终导致了DW871的矮化.
文献关键词:
甘蓝型油菜(Brassica napus L.);转录组;矮化性状;DW871;株型
作者姓名:
罗京;李超;张瑞茂;赵德刚;高志宏;王芳;杨元雨;王转转;王敏
作者机构:
贵州师范大学生命科学学院,贵州贵阳,550025;贵州省农业科学院油料研究所,贵州贵阳,550006;贵州省农业科学院油菜研究所,贵州贵阳,550009;贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室,山地生态与农业生物工程协同创新中心,贵州贵阳,550025
引用格式:
[1]罗京;李超;张瑞茂;赵德刚;高志宏;王芳;杨元雨;王转转;王敏-.转录组测序分析甘蓝型油菜DW871矮化性状)[J].中国油料作物学报,2022(01):14-24
A类:
DW871,HW871
B类:
转录组测序分析,甘蓝型油菜,矮化性状,株型,品系,表达模式,抽薹,茎秆,基因表达分析,差异基因,富集分析,亚类,果胶降解,降解代谢,代谢途径,生长素信号转导,信号转导途径,木质素,合成途径,细胞伸长,细胞壁,细胞分裂,常以,信号传导,PAL,CCR,生理生化,Brassica,napus
AB值:
0.220526
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