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典型文献
血浆蛋白质组学在高原红细胞增多症诊断和发病机制研究中的应用价值
文献摘要:
目的:探讨血浆蛋白质组学在高原红细胞增多症(HAPC)诊断和发病机制研究中的应用价值。方法:选取2020年1月至2021年1月青海省人民医院10例HAPC患者为试验组,其中男4例,女6例,年龄(46±4)岁。筛选同期同海拔健康对照者10名为对照组,其中男5名,女5名,年龄(44±4)岁。运用高效液相色谱-质谱联用方法进行差异蛋白鉴定和定量,针对筛选出的差异蛋白进行基因本体(GO)功能富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能富集分析和互作网络分析。结果:试验组和对照组共筛选出有定量值的差异蛋白共117个,只在试验组有定量值的显著上调蛋白数为45个,只在对照组有定量值的显著下调蛋白数为40个,试验组与对照组均有定量值的差异表达蛋白为32个。与对照组比较,试验组32个差异表达蛋白中,11个表达下调,21个表达上调。GO功能富集分析结果显示,差异蛋白参与的生物学过程主要包括免疫反应、补体激活、蛋白级联激活、凝血系统;KEGG功能富集分析结果显示,差异蛋白参与的主要生化代谢途径和信号转导途径为轴突导向、溶酶体、细胞黏附分子、脂质和动脉粥样硬化、造血细胞谱系、胆固醇代谢;显著富集的结构域主要在免疫球蛋白样结构域、类EGF域、纤维连接蛋白Ⅲ型超家族、丝氨酸蛋白酶、Sushi/SCR/CCP超家族;差异蛋白互作分析结果显示,互作评分>700分,节点数最多的前10个差异蛋白分别为MPO、RPS27A、ARG1、GM2A、TIMP1、CRP、FABP5、HBB、S100A7、RHOA。结论:血浆蛋白质组学分析技术有助于识别在HAPC发展中的相关蛋白标志物,为HAPC的诊断及发病机制研究提供参考。
文献关键词:
蛋白质组学;高原红细胞增多症;血浆;生信分析
作者姓名:
李晓彤;阿祥仁
作者机构:
青海大学研究生院,西宁 810000;青海省人民医院医学检验科 青海省检验医学重点实验室 青海省医学检验临床医学研究中心,西宁 810007
文献出处:
引用格式:
[1]李晓彤;阿祥仁-.血浆蛋白质组学在高原红细胞增多症诊断和发病机制研究中的应用价值)[J].中华医学杂志,2022(45):3624-3629
A类:
GM2A
B类:
血浆蛋白,蛋白质组学,高原红细胞增多症,HAPC,青海省,中男,质谱联用方法,差异蛋白,蛋白鉴定,基因本体,功能富集分析,京都基因与基因组百科全书,互作网络,差异表达蛋白,白参,生物学过程,免疫反应,补体激活,凝血系统,代谢途径,信号转导途径,轴突导向,溶酶体,细胞黏附分子,动脉粥样硬化,造血细胞,胆固醇代谢,结构域,免疫球蛋白,EGF,纤维连接蛋白,超家族,丝氨酸蛋白酶,Sushi,SCR,CCP,蛋白互作分析,数最多,MPO,RPS27A,ARG1,TIMP1,FABP5,HBB,S100A7,RHOA,组学分析技术,生信分析
AB值:
0.295944
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