典型文献
小儿扩张型心肌病血清蛋白及microRNA表达谱的生物信息学分析和发病机制
文献摘要：
目的:对小儿扩张型心肌病(pediatric dilated cardiomyopathy,PDCM)血清蛋白及microRNA(miRNA)表达谱进行生物信息学分析,探讨其发病机制.方法:对PDCM血清蛋白芯片数据进行差异分析及基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析.对PDCM miRNA表达谱挑选部分差异表达miRNA,预测靶基因,与差异血清蛋白/基因取交集,获取共享基因,构建miRNA-mRNA关系对,并行GO和KEGG通路富集分析.结果:PDCM差异血清蛋白富集到细胞黏附调节、免疫调控、含胶原的细胞外基质等GO子集中.差异蛋白主要参与趋化因子信号通路、肾素分泌、肾素-血管紧张素系统、细胞因子-细胞因子受体相互作用、扩张型心肌病(dilated cardiomyopathy,DCM)、醛固酮的合成和分泌、病毒蛋白与细胞因子及细胞因子受体的相互作用等10条信号通路中.4个下调miRNA行靶基因预测后与差异血清蛋白/基因取交集,共8个共享基因,即HSPD1、LIFR、RPS7、ANXA2、PDPK1、EIF4G2、AGT和PRKCA.共享基因显著富集到心肌肥厚正调控等GO子集中;及醛固酮的合成和分泌及调节钠重吸收、心肌细胞中的肾上腺素能信号和蛋白激酶B-哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(Akt-mammalian target of rapamycin,Akt-mTOR)通路等13条通路中.结论:通过分析PDCM血清蛋白及miRNA表达谱,有助于进一步了解该病发病机制,为临床诊疗提供思路.
文献关键词：
扩张型心肌病;microRNA;差异表达基因;生物信息学;富集分析
中图分类号：
作者姓名：
刘娜;赵倩倩;尤红俊
作者机构：
陕西省人民医院儿科,西安 710068;空军军医大学第一附属医院临床免疫科,西安 710032;陕西省人民医院心血管内科,西安 710068
文献出处：
引用格式：
[1]刘娜;赵倩倩;尤红俊-.小儿扩张型心肌病血清蛋白及microRNA表达谱的生物信息学分析和发病机制)[J].临床与病理杂志,2022(09):2063-2073
A类：
PDCM,RPS7
B类：
小儿,扩张型心肌病,血清蛋白,白及,microRNA,表达谱,生物信息学分析,pediatric,dilated,cardiomyopathy,miRNA,蛋白芯片,基因本体论,Ontology,京都基因与基因组百科全书,Kyoto,Encyclopedia,Genes,Genomes,通路富集分析,交集,细胞黏附,免疫调控,细胞外基质,子集,差异蛋白,趋化因子,肾素,血管紧张素,细胞因子受体,醛固酮,病毒蛋白,靶基因预测,HSPD1,LIFR,ANXA2,PDPK1,EIF4G2,AGT,PRKCA,心肌肥厚,正调控,重吸收,心肌细胞,肾上腺素,蛋白激酶,哺乳动物雷帕霉素靶蛋白,Akt,mammalian,target,rapamycin,mTOR,临床诊疗,差异表达基因
AB值：
0.300095
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